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J-GLOBAL ID：202202245342431722   整理番号：22A0226552

ゲノムワイドなメチロームパターン予測ネットワーク解析は,心血管系列をアンダゴするための間葉系幹細胞の傾向を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide methylome pattern predictive network analysis reveal mesenchymal stem cell’s propensity to undergo cardiovascular lineage

著者 (10件)： Govarthanan Kavitha (Stem Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, Chennai, Tamilnadu, India) ,  Gupta Piyush Kumar (Department of Life Sciences, School of Basic Sciences and Research, Sharda University, Greater Noida, India) ,  Patra Bamadeb (Stem Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, Chennai, Tamilnadu, India) ,  Ramasamy Deepa (Stem Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, Chennai, Tamilnadu, India) ,  E Binita Zipporah (Stem Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, Chennai, Tamilnadu, India) ,  Sharma Vineeta (Stem Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, Chennai, Tamilnadu, India) ,  Yadav Rajesh (Stem Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, Chennai, Tamilnadu, India) ,  Kumar Pavitra (Department of Biomedical Research, University of Bern, Bern, Switzerland) ,  Sathish Dayakshini (Department of Electronics and Communication Engineering, St. Joseph Engineering College, Mangaluru, India) ,  Verma Rama Shanker (Stem Cell and Molecular Biology Laboratory, Department of Biotechnology, Bhupat and Jyoti Mehta School of Biosciences, Indian Institute of Technology Madras, Chennai, Tamilnadu, India)
資料名： 3 Biotech  (3 Biotech)
巻： 12  号： 1  ページ： 12  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3974A  ISSN： 2190-5738  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： グローバルメチロームプロファイルを用いた心血管系統予測に対する間葉幹細胞(MSC)分化は,再生医療における有望な有用性を強調する。よく知られた心臓系誘導因子である5-Azaを用いて,心臓血管系統に対する傾向予測を検討した。カスタマイズした180Kマイクロアレイを行い,MSCと5-AC処理MSCの両方で,Ingenuity経路分析(IPA)により,グローバルに異なるメチル化領域を分析した。クラスター濃縮ツールは,差別的に豊富な遺伝子を選別し,さらに,インタラクティブネットワークを構築するために注釈付けした。予測分析は,天然MSCで活性である心臓血管系譜に関係する経路を明らかにし,in vitroで心臓,平滑筋細胞,および内皮系統を受ける傾向が高いことを示唆した。興味深いことに,遺伝子相互作用ネットワークも,主要な幹細胞性遺伝子ネットワークNANOGとKLF6,心臓特異的転写因子GATA4,NKX2.5,およびTBX5を天然MSCでアップレギュレートした。さらに,リアルタイムPCRおよび免疫染色およびブロッティング分析を用いて,天然MSCにおいて,Brachurry,CD105,CD90,CD31,KDRおよびACTIN(心臓,サルコマー,平滑筋)の様々な形態のような心血管系統特異的マーカーの発現を検証した。5-AC処理MSCでは,モザイク相互作用ネットワークが骨形成と心臓系譜に向って観察され,5-AC処理はMSCにおける非特異的系統誘導をもたらすが,デフォルトによるMSCは心血管系統を受ける傾向が高いことを示した。Copyright King Abdulaziz City for Science and Technology 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *ネットワーク ,  *血管 ,  心臓 ,  メチル化 ,  遺伝子 ,  分化 ,  平滑筋 ,  クラスタ ,  内皮 ,  転写因子 ,  in vitro実験 ,  免疫染色 ,  再生医療 ,  *間葉系幹細胞

著者キーワード (5件)： メチル化 ,  経路 ,  予測 ,  系譜 ,  間葉系幹細胞

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  循環系の基礎医学  (GJ01020K)

タイトルに関連する用語 (7件)： ゲノム ,  予測 ,  ネットワーク解析 ,  心血管 ,  系列 ,  間葉系幹細胞 ,  傾向