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J-GLOBAL ID：202202245904581541   整理番号：22A0651780

炎症応答と関連した遺伝子シグネチャを用いた肝細胞癌予後および免疫細胞浸潤の予測【JST・京大機械翻訳】

Prediction of Hepatocellular Carcinoma Prognosis and Immune Cell Infiltration Using Gene Signature Associated with Inflammatory Response

著者 (9件)： Da Bin-Bin (Department of Minimally Invasive Interventional Medicine Yunnan Cancer Hospital, Kunming 650118, China) ,  Luo Shuai (Department of Minimally Invasive Interventional Medicine Yunnan Cancer Hospital, Kunming 650118, China) ,  Huang Ming (Department of Minimally Invasive Interventional Medicine Yunnan Cancer Hospital, Kunming 650118, China) ,  Song Fei (Department of Minimally Invasive Interventional Medicine Yunnan Cancer Hospital, Kunming 650118, China) ,  Ding Rong (Department of Minimally Invasive Interventional Medicine Yunnan Cancer Hospital, Kunming 650118, China) ,  Xiao Yao (Department of Minimally Invasive Interventional Medicine Yunnan Cancer Hospital, Kunming 650118, China) ,  Fu Yang (CT Room, Kunming First People’s Hospital, Kunming 650000, China) ,  Yang Yin-Shan (Department of Minimally Invasive Interventional Medicine Yunnan Cancer Hospital, Kunming 650118, China) ,  Wang Hai-Lei (Hepatobiliary Pancreatic Vascular Surgery, Kunming First People’s Hospital, Kunming 650031, China)
資料名： Computational and Mathematical Methods in Medicine (Web)  (Computational and Mathematical Methods in Medicine (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7693A  ISSN： 1748-670X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 炎症反応は癌発生に影響し,種々の腫瘍における予後バイオマーカーとして使用できることを示した。しかし,肝細胞癌(HCC)における炎症反応に関連する遺伝子の関連性は不明である。癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースを,必須炎症反応関連遺伝子(IFRGs)を発見するために,加重遺伝子共発現ネットワーク分析(WGCNA)と差分分析を用いて分析した。単変量および多変量のCox回帰研究を用い,予後IFRGsシグネチャを開発した。さらに,遺伝子セット濃縮分析(GSEA)を用いてIFRGsシグネチャの生物学的機能を推定した。最後に,単一試料GSEA(ssGSEA)とx細胞を用いて免疫細胞浸潤を推定した。著者らの結果は,主要なHCC IFRGsの間で,2つの(DNASE1L3とKLKB1)が予測IFRGシグネチャを作成するために採用されたことを明らかにした。IFRG署名は,Kaplan-Meier時間依存的ロック曲線分析として,全生存(O.S)を正しく予測することができた。また,病理学的腫瘍ステージとTステージにリンクし,HCCの予後予測因子として使用できる可能性がある。GSEA分析は,IFRGシグネチャがHCCの免疫反応に影響すると結論した。免疫学的細胞浸潤と免疫チェックポイント分子発現は,高リスクと低リスク群で異なった。著者らの知見の結果として,DNASILEは腫瘍微小環境において役割を果たす可能性がある。しかし,DNASE1L3とKLKB1の役割を確認するためには,より多くの研究が必要である。Copyright 2022 Bin-Bin Da et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *遺伝子 ,  腫瘍 ,  発癌 ,  免疫反応 ,  生物活性 ,  *予後 ,  遺伝子発現 ,  *肝細胞癌 ,  バイオマーカー ,  *細胞浸潤
準シソーラス用語： アトラス ,  ネットワーク解析 ,  予後因子 ,  共発現 ,  *炎症反応 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

引用文献 (58件)：

• F. Bray, J. Ferlay, I. Soerjomataram, R. L. Siegel, L. A. Torre, A. Jemal, "Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries," CA: a Cancer Journal for Clinicians, vol. 68, no. 6, pp. 394-424, 2018.
• A. Jemal, F. Bray, M. M. Center, J. Ferlay, E. Ward, D. Forman, "Global cancer statistics," CA: a Cancer Journal for Clinicians, vol. 61, no. 2, pp. 69-90, 2011.
• P. Galle, A. Forner, J. M. Llovet, V. Mazzaferro, F. Piscaglia, J. L. Raoul, P. Schirmacher, V. Vilgrain, "EASL clinical practice guidelines: management of hepatocellular carcinoma," Journal of Hepatology, vol. 69, no. 1, pp. 182-236, 2018.
• J. Llovet, J. Zucman-Rossi, E. Pikarsky, B. Sangro, M. Schwartz, M. Sherman, G. Gores, "Hepatocellular carcinoma," Nature Reviews Disease Primers, vol. 2, no. 1, 2016.
• J. D. Yang, L. R. Roberts, "Hepatocellular carcinoma: a global view," Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, vol. 7, no. 8, pp. 448-458, 2010.

タイトルに関連する用語 (8件)： 炎症応答 ,  遺伝子 ,  シグネチャ ,  肝細胞癌 ,  予後 ,  免疫細胞 ,  浸潤 ,  予測