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J-GLOBAL ID：202202245967488981   整理番号：22A1155665

公共データベースにおけるHydrachnidia(ダニ目,寄生虫門)のミトコンドリアCOI配列のエラーの評価【JST・京大機械翻訳】

An evaluation of errors in the mitochondrial COI sequences of Hydrachnidia (Acari, Parasitengona) in public databases

著者 (5件)： Pelaez Maria L. (Museo Nacional de Ciencias Naturales, Madrid, Spain) ,  Horreo Jose L. (UMIB Research Unit of Biodiversity (UO, CSIC, PA), Oviedo University - Campus Mieres, Mieres, Spain) ,  Horreo Jose L. (Department of Genetics, Physiology and Microbiology, Complutense University of Madrid, Madrid, Spain) ,  Garcia-Jimenez Ricardo (Museo Nacional de Ciencias Naturales, Madrid, Spain) ,  Valdecasas Antonio G. (Museo Nacional de Ciencias Naturales, Madrid, Spain)
資料名： Experimental & Applied Acarology  (Experimental & Applied Acarology)
巻： 86  号： 3  ページ： 371-384  発行年： 2022年 
JST資料番号： C0142C  ISSN： 0168-8162  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 公共分子データベースは,その有用性がそれら内のデータの健全性に依存する現代の分類学的研究の基本的ツールである。ここでは,サンプリング,試料同定および分子処理(消化,増幅および配列決定)からデータパイプラインに沿って起こる可能性のある誤差を,ケーススタディとしてHydrachnidia(Acari,Parasitengona)のDNA配列を用いて,これらのデータベースへの配列のサブミッションに研究した。結果は,分子情報が今日まで知られているHydrachnidia種の約3%に利用可能であることを示した。しかし,この小さな割合の中で,誤差が分析した種のほぼ5%(配列の0.5%と属のほぼ11%)に存在する。本研究は,Hydrachnidiaに利用可能な遺伝的データの不足を強調するが,DNA配列における誤差の割合は比較的小さい。そうであっても,それは,特に種同定のために,公共データベースからのDNA配列の使用に関連した危険性を強調し,(ポスト)ゲノム時代におけるエラーの強化を避けるため,より大きな品質管理手段および/またはプロトコルの必要性を強化する。最後に,本研究は,潜在的誤差が種内の隠れた多様性を明らかにするかもしれないことを強調する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature Switzerland AG 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 品質管理 ,  *データベース ,  遺伝 ,  *寄生虫 ,  消化 ,  ヌクレオチド配列 ,  *ミトコンドリア ,  系統発生 ,  ゲノム ,  事例研究 ,  同定 ,  健全性
準シソーラス用語： GenBank ,  種判別 ,  DNA配列 ,  分類学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： BOLD ,  隠れた多様性 ,  GenBank ,  系統発生 ,  種の同定 ,  水ダニ

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (7件)： データベース ,  ダニ目 ,  寄生虫 ,  ミトコンドリア ,  COI ,  エラー ,  評価