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J-GLOBAL ID：202202246046449283   整理番号：22A1085006

タイのイネ品種の塩分ストレス応答とSNPに基づく系統発生解析【JST・京大機械翻訳】

Salt stress responses and SNP-based phylogenetic analysis of Thai rice cultivars

著者 (11件)： Habila Susinya (Center of Excellence in Environment and Plant Physiology, Dep. of Botany, Faculty of Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand) ,  Habila Susinya (Dep. of Plant Science and Biotechnology, Faculty of Natural Science, Univ. of Jos, Jos Plateau State, Nigeria) ,  Khunpolwattana Nopphakhun (Center of Excellence in Environment and Plant Physiology, Dep. of Botany, Faculty of Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand) ,  Chantarachot Thanin (Center of Excellence in Environment and Plant Physiology, Dep. of Botany, Faculty of Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand) ,  Buaboocha Teerapong (Molecular Crop Research Unit, Dep. of Biochemistry, Faculty of Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand) ,  Buaboocha Teerapong (Omics Sciences Center, Faculty of Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand) ,  Comai Luca (Genome Center and Dep. of Plant Biology, UC Davis Genome Center, Univ. of California-Davis, Davis, CA, 95616, USA) ,  Chadchawan Supachitra (Center of Excellence in Environment and Plant Physiology, Dep. of Botany, Faculty of Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand) ,  Chadchawan Supachitra (Omics Sciences Center, Faculty of Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand) ,  Pongpanich Monnat (Omics Sciences Center, Faculty of Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand) ,  Pongpanich Monnat (Dep. of Mathematics and Computer Science, Faculty Science, Chulalongkorn Univ., Pathum Wan District, Bangkok, 10330, Thailand)
資料名： Plant Genome  (Plant Genome)
巻： 15  号： 1  ページ： e20189  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5739A  ISSN： 1940-3372  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝的多様性は耐塩性イネ(Oryza sativa L.)品種の開発に重要である。あるタイのイネ系統は,成体または生殖段階で耐塩性を示すが,実生段階での塩分に対する応答は知られていない。本研究では,8つのタイ品種と標準塩耐性品種と感受性系統を含む合計10のイネ品種/系統を水耕システムを用いてスクリーニングし,実生段階で耐塩性遺伝子型を同定した。異なる形態生理学的指標を用いて,耐性および感受性遺伝子型を分類した。系統学的分析を行い,栽培品種間の進化関係を決定した。結果は,ΔΨLai Mahk’,「JJao Khao’,「LuLuang Pratahn’,およびΔΨMa Gawk’が,標準塩耐性チェック’Pokokali’に匹敵する塩ストレス耐性を示したことを示した。全ゲノム単一ヌクレオチド多型(SNP)に基づく系統発生分析は,タイのイネ品種が単系統であり,PokkaliとIR29に遠隔に関連することを示した。Lai MahkとLuang Pratahnは,分析に全エキソームSNPを用いた場合に密接に関連した。これは164の耐塩性遺伝子および転写調節遺伝子からのSNPの分析の場合でもある。耐性品種は16の遺伝子に対して同じハプロタイプを共有した。全体として,この研究の知見は,塩分耐性のためのイネ育種プログラムに使用できる4つの塩ストレス耐性タイイネ品種を同定した。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  遺伝子型 ,  *ストレス ,  生殖 ,  *塩分 ,  *系統発生 ,  *イネ ,  成体 ,  水耕 ,  *品種 ,  実生 ,  栽培品種 ,  ハプロタイプ ,  一塩基多型
準シソーラス用語： *塩分ストレス ,  転写調節 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 稲作  (FC03020C) ,  植物生理学一般  (EH02010Y) ,  植物に対する影響  (EE05030G)

タイトルに関連する用語 (8件)： タイ ,  イネ ,  品種 ,  塩分ストレス ,  応答 ,  SNP ,  系統発生 ,  解析