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J-GLOBAL ID：202202246552310393   整理番号：22A1153755

腎細胞癌組織における標的蛋白質定量化のための大規模アッセイライブラリ【JST・京大機械翻訳】

A large-scale assay library for targeted protein quantification in renal cell carcinoma tissues

著者 (12件)： Lapcik Petr (Department of Biochemistry, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, Czech Republic) ,  Janacova Lucia (Department of Biochemistry, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, Czech Republic) ,  Bouchalova Pavla (Department of Biochemistry, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, Czech Republic) ,  Potesil David (Central European Institute of Technology, Masaryk University, Brno, Czech Republic) ,  Podhorec Jan (Department of Comprehensive Cancer Care, Masaryk Memorial Cancer Institute, Brno, Czech Republic) ,  Podhorec Jan (Department of Comprehensive Cancer Care, Faculty of Medicine, Masaryk University, Brno, Czech Republic) ,  Hora Milan (Department of Urology, Faculty of Medicine and University Hospital in Pilsen, Charles University, Plzen, Czech Republic) ,  Poprach Alexandr (Department of Comprehensive Cancer Care, Masaryk Memorial Cancer Institute, Brno, Czech Republic) ,  Poprach Alexandr (Department of Comprehensive Cancer Care, Faculty of Medicine, Masaryk University, Brno, Czech Republic) ,  Fiala Ondrej (Department of Oncology and Radiotherapy, Faculty of Medicine and University Hospital in Pilsen, Charles University, Plzen, Czech Republic) ,  Fiala Ondrej (Laboratory of Cancer Treatment and Tissue Regeneration, Biomedical Center, Faculty of Medicine in Pilsen, Charles University, Plzen, Czech Republic) ,  Bouchal Pavel (Department of Biochemistry, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, Czech Republic)
資料名： Proteomics  (Proteomics)
巻： 22  号： 7  ページ： e2100228  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1303A  ISSN： 1615-9853  CODEN： PROTC  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腎細胞癌(RCC)は全癌発生率の2.2%を示す。しかしながら,蛋白質レベルでの予後または予測RCCバイオマーカーは,大部分欠けている。局所及び転移性RCCのプロテオミクス研究を支援するために,悪性及び正常腎臓組織における正確な蛋白質定量のための標的化質量分析アッセイの新しいライブラリーを紹介した。86の初期に局在化したRCC,75の転移性RCCおよび17の隣接する非癌性新鮮凍結組織溶解物がトリプシン消化され,プールされ,親水性クロマトグラフィーを用いて分画された。画分を,データ依存性取得(DDA)モードでQExactive HF-X質量分析計でLC-MS/MSを用いて分析した。得られたスペクトルライブラリーは7960の蛋白質群(FDR=1%)を表す77,817のペプチドを含む。さらに,データ非依存性取得(DIA)モードで測定した4つのRCCデータセットに対するこのライブラリーの適用性を確認し,LC-MS/MS装置に依存してRCCプロテオームの実質的に増加した部分の特定定量を示した。標的DIAデータ抽出の結果に対するライブラリーの試料特異性の影響を,2つのパンヒトライブラリーによる2つのデータセットの並列解析により示した。新しいRCC特異的ライブラリーは,分子レベルでのRCC開発のより良い理解に寄与する可能性があり,新しい診断および治療標的につながる。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 腎臓 ,  クロマトグラフィー ,  ペプチド ,  *タンパク質 ,  凍結 ,  ヒト ,  予後 ,  ターゲティング ,  *腎細胞癌 ,  バイオマーカー ,  プロテオミクス ,  プロテオーム
準シソーラス用語： LC/MS/MS ,  トリプシン分解 ,  治療標的 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アッセイライブラリ ,  データ独立取得 ,  質量分析 ,  プロテオミクス ,  腎細胞癌

分類 (2件)： 泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 腎細胞癌 ,  組織 ,  標的蛋白質 ,  定量化 ,  大規模 ,  アッセイ ,  ライブラリ