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J-GLOBAL ID：202202246889108190   整理番号：22A0431512

ADA2遺伝子変異体の包括的解析および機能ベースアプローチにより駆動されたキャリア頻度の推定【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive analysis of ADA2 genetic variants and estimation of carrier frequency driven by a function-based approach

著者 (21件)： Jee Hyuk (Division of Immunology, Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Huang Zhengping (Department of Rheumatology and Immunology, Guangdong Second Provincial General Hospital, Guangzhou, China) ,  Huang Zhengping (Division of Rheumatology, Inflammation, and Immunity, Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Baxter Samantha (Center for Mendelian Genomics, The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Mass) ,  Huang Yuelong (Division of Rheumatology, Inflammation, and Immunity, Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Taylor Maria L. (Division of Immunology, Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Henderson Lauren A. (Division of Immunology, Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Rosenzweig Sofia (Inflammatory Disease Section, National Human Genome Research Institute, Bethesda, Md) ,  Sharma Aman (Clinical Immunology and Rheumatology Services, Department of Internal Medicine, Postgraduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India) ,  Chambers Eugene P. (Department of Surgery, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, Tenn) ,  Chambers Eugene P. (DADA2 Foundation, Nashville, Tenn) ,  Hershfield Michael S. (Department of Medicine and Biochemistry, Duke University School of Medicine, Durham, NC) ,  Zhou Qing (Life Sciences Institute, Zhejiang University, Zhejiang, China) ,  Dedeoglu Fatma (Division of Immunology, Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Aksentijevich Ivona (Inflammatory Disease Section, National Human Genome Research Institute, Bethesda, Md) ,  Nigrovic Peter A. (Division of Immunology, Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Nigrovic Peter A. (Division of Rheumatology, Inflammation, and Immunity, Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  O’Donnell-Luria Anne (Center for Mendelian Genomics, The Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Mass) ,  O’Donnell-Luria Anne (Division of Genetics and Genomics, Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Lee Pui Y. (Division of Immunology, Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Lee Pui Y. (Division of Rheumatology, Inflammation, and Immunity, Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, Mass)
資料名： Journal of Allergy and Clinical Immunology  (Journal of Allergy and Clinical Immunology)
巻： 149  号： 1  ページ： 379-387  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0182B  ISSN： 0091-6749  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アデノシンデアミナーゼ2(DADA2)の欠乏は,有害なADA2変異体により生じる自己炎症性疾患である。一般集団におけるこれらの変異体の頻度,従って予想される疾患罹患率は不明のままである。ADA2変異体の機能的影響とキャリア頻度を特性化することを目的とした。ゲノム凝集データベースで同定されたDADA2関連変異体及び集団変異体を含む163ADA2変異体の機能的研究及びin silico解析を行った。有害な変異体の凝集体周波数を用いてキャリア速度を推定した。ADA2変異体の機能的研究は,DADA2関連変異体の85の77(91%)がADA2酵素機能を>75%減少させたことを明らかにした。データベースにおける100ADA2変異体の解析は,良性対有害な変異体の二分切断よりも,ADA2機能に対する完全な影響スペクトルを示した。高感度と特異性を有するADA2変異体の影響を効果的に予測し,in vitroでのADA2変異体の残存機能と,これらの変異体を持つ個体の血漿ADA2活性(n=45;r=0.649;P<0.0001)の間の相関を確認した。潜在的病原性を定義するためのカットオフとして<25%の残存酵素活性を用いて,データベース集団データとの我々の結果の統合は,222000人の個人におけるΔΨ1の予想されるDADA2疾患罹患率に対応する236個体における少なくとも1の推定キャリア頻度を明らかにした。機能的アノテーションはADA2変異体の解釈を誘導し,DADA2キャリア頻度と疾患罹患率の推定を可能にするフレームワークを作成する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 凝集 ,  データベース ,  血漿 ,  酵素 ,  アデノシンデアミナーゼ ,  *遺伝子 ,  酵素活性度 ,  スペクトル ,  ゲノム ,  病原性 ,  in vitro実験 ,  アノテーション ,  凝集体
準シソーラス用語： 特異性 ,  in silico解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アデノシンデアミナーゼ2 ,  DADA2 ,  ADA2変異体 ,  キャリア周波数 ,  疾病有病率

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 遺伝子変異 ,  解析 ,  キャリア ,  頻度 ,  推定