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J-GLOBAL ID：202202247893619138   整理番号：22A1178306

ゲノムスキミングはParisセクションAxiparis(Melanthiaceae)における種限界の明確化に寄与する【JST・京大機械翻訳】

Genome Skimming Contributes to Clarifying Species Limits in Paris Section Axiparis (Melanthiaceae)

著者 (15件)： Ji Yunheng (CAS Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Ji Yunheng (Yunnan Key Laboratory for Integrative Conservation of Plant Species With Extremely Small Population, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Yang Jin (CAS Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Yang Jin (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Landis Jacob B. (Section of Plant Biology and the L. H. Bailey Hortorium, School of Integrative Plant Science, Cornell University, Ithaca, NY, United States) ,  Landis Jacob B. (BTI Computational Biology Center, Boyce Thompson Institute, Ithaca, NY, United States) ,  Wang Shuying (CAS Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Wang Shuying (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Jin Lei (CAS Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Jin Lei (School of Traditional Chinese Medicine, Guangdong Pharmaceutical University, Guangzhou, China) ,  Xie Pingxuan (CAS Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Xie Pingxuan (School of Traditional Chinese Medicine, Guangdong Pharmaceutical University, Guangzhou, China) ,  Liu Haiyang (State Key Laboratory of Phytochemistry and Plant Resources in West China, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Yang Jun-Bo (Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Yi Ting-Shuang (Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 832034  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Paris L.セクションAxiparis H.Li(Melanthiaceae)は,種の制限に関してかなりの混乱を有する分類学的に複雑な分類群である。分類群で現在認識された各種の形態と地理的分布の分析に基づいて,P.sect.Axiparisの種の数を9から2に減少させる修正スキームを提案した。この分類学的提案を検証するために,著者らは,1種あたり多重アクセッションをサンプリングすることにより,P.sect.Axiparisの9つの記載された種全体で51の個々の植物の色素体ゲノム(プラストーム)と核リボソームDNA(nrDNA)領域を回復するゲノムスキミングアプローチを採用した。P.sect.Axiparisの種境界を,系統発生推論と3つの異なる配列ベースの種制限法(ABGD,mPTP,およびSDP)を使用して調査した。相互に補強した結果は,形態学的一意性,非重複分布,遺伝的特異性,および潜在的生殖隔離を示すP.sect.Axiparis(Paris forestii s.l.およびP.vaniotii s.l.)には2種レベルの分類単位があり,提案した種制限スキームに強い支持を提供することを示した。本研究は,以前の形態に基づく分類学が種境界を描写するために,種境界を描写し,従って,P.sect.Axiparisの真の種多様性の過大評価をもたらすことを確認した。この知見は種限界を明らかにし,P.sect.Axiparisにおけるロバストな分類学的修正を促進するであろう。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝 ,  系統発生 ,  多重化 ,  地理的分布 ,  形態 ,  一意性 ,  *推論 ,  ロバスト性 ,  生物多様性 ,  モルフォロジー
準シソーラス用語： リボソームDNA ,  生殖隔離 ,  分類学 ,  分類群 ,  nrDNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： プラストーム ,  リボソームDNA ,  分類学 ,  Paris Linn ,  種の限界

分類 (2件)： 植物分類学  (EH01030N) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (99件)：

• Aguilar C., Wood P. L., Cusi J. C., Guzmán A., Huari F., Lundberg M., et al (2013). Integrative taxonomy and preliminary assessment of species limits in the Liolaemus walkeri complex (Squamata, Liolaemidae) with descriptions of three new species from Peru. Zookeys 364 47-91. doi: 10.3897/zookeys.364.6109
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• Bickford D., Lohman D. J., Sodhi N. S., Ng P. K., Meier R., Winker K., et al (2007). Cryptic species as a window on diversity and conservation. Trends Ecol. Evol. 22 148-155. doi: 10.1016/j.tree.2006.11.004
• Bolger A. M., Lohse M., Usadel B. (2014). Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. Bioinformatics 30 2114-2120. doi: 10.1093/bioinformatics/btu170

タイトルに関連する用語 (2件)： 種 ,  限界