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J-GLOBAL ID：202202248029692648   整理番号：22A0948592

ニューログロビンを過剰発現する神経芽腫細胞のプロテオームデータ【JST・京大機械翻訳】

Proteome data of neuroblastoma cells overexpressing Neuroglobin

著者 (10件)： Costanzo Michele (Department of Molecular Medicine and Medical Biotechnology, University of Naples Federico II, Naples 80131, Italy) ,  Costanzo Michele (CEINGE-Biotecnologie Avanzate s.c.ar.l., Naples 80145, Italy) ,  Caterino Marianna (Department of Molecular Medicine and Medical Biotechnology, University of Naples Federico II, Naples 80131, Italy) ,  Caterino Marianna (CEINGE-Biotecnologie Avanzate s.c.ar.l., Naples 80145, Italy) ,  Salvatori Illari (Fondazione Santa Lucia IRCCS, c/o CERC, Rome 00143, Italy) ,  Manganelli Valeria (Department of Experimental Medicine, ”Sapienza” University of Rome, Rome 00161, Italy) ,  Ferri Alberto (Fondazione Santa Lucia IRCCS, c/o CERC, Rome 00143, Italy) ,  Misasi Roberta (Department of Experimental Medicine, ”Sapienza” University of Rome, Rome 00161, Italy) ,  Ruoppolo Margherita (Department of Molecular Medicine and Medical Biotechnology, University of Naples Federico II, Naples 80131, Italy) ,  Ruoppolo Margherita (CEINGE-Biotecnologie Avanzate s.c.ar.l., Naples 80145, Italy)
資料名： Data in Brief  (Data in Brief)
巻： 41  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3049A  ISSN： 2352-3409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本稿では,ニューログロビン(NGB)を安定的に過剰発現するヒト神経芽細胞腫細胞のプロテオームに関するデータを提示する。NGBの神経保護的役割は明確に確立されているが,NGB過剰発現に依存する関連する機構的過程は知られていない。この疑問に取り組むため,NGB-FLAG構築物を過剰発現する神経芽細胞腫のSH-SY5Y細胞モデルを用い,ショットガン無標識定量(LFQ)プロテオミクスを行い,対照(CTRL)として空ベクターをトランスフェクトした野生型細胞を用いた。1条件当たり6つの生物学的試料からのプロテオームを,S-Trap試料調製とそれに続くLTQ-Orbitrap XL質量分析計によるLC-MS/MS分析を用いて消化した。定量分析をMaxQuantのLFQアルゴリズムを用いて行い,2580の同定された蛋白質に対して1654の正しく定量された蛋白質を得た。最後に,Perseusプラットフォーム内の2つの分析グループの統計比較は178の差次的蛋白質を同定した(107の上方制御と71の下方制御)。さらに,多変量統計解析をMetaboAnalyst5.0ソフトウェアを用いて行った。MSプロテオミクスデータは,データセット識別子PXD029012によるプロテオームX変化を介して利用可能である。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  定量分析 ,  ヒト ,  *ヘムタンパク質 ,  ソフトウェア ,  標識法 ,  *遺伝子発現 ,  野生型 ,  ベクター ,  *神経芽腫 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  プロテオミクス ,  *プロテオーム
準シソーラス用語： LC/MS/MS ,  *ニューログロビン ,  無標識 ,  *過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： プロテオミクス ,  ニューログロビン ,  無標識定量化 ,  LC-MS/MS ,  Sトラップ ,  最大量 ,  ペルセウス ,  メタボアナリスト

分類 (1件)： 細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (4件)： ニューログロビン ,  過剰発現 ,  神経芽腫細胞 ,  プロテオーム