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J-GLOBAL ID：202202248164900854   整理番号：22A0297428

カナリア諸島固有クモDysdera silvatica(Arachnida,クモ目)の染色体規模集合はケリセレートにおける化学受容体遺伝子ファミリーの起源とゲノム構造に光を当てる【JST・京大機械翻訳】

The chromosome-scale assembly of the Canary Islands endemic spider Dysdera silvatica (Arachnida, Araneae) sheds light on the origin and genome structure of chemoreceptor gene families in chelicerates

著者 (9件)： Escuer Paula (Departament de Genetica, Microbiologia i Estadistica & Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Pisarenco Vadim A. (Departament de Genetica, Microbiologia i Estadistica & Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Fernandez-Ruiz Angel A. (Departament de Genetica, Microbiologia i Estadistica & Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Vizueta Joel (Departament de Genetica, Microbiologia i Estadistica & Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Vizueta Joel (Section for Ecology and Evolution, Department of Biology, Villum Centre for Biodiversity Genomics, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Sanchez-Herrero Jose F. (High Content Genomics and Bioinformatics Unit, Institut d’Investigacio en Ciencies de la Salut Germans Trias i Pujol, Badalona, Spain) ,  Arnedo Miquel A. (Departament de Biologia Evolutiva, Ecologia i Ciencies Ambientals & Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Sanchez-Gracia Alejandro (Departament de Genetica, Microbiologia i Estadistica & Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Rozas Julio (Departament de Genetica, Microbiologia i Estadistica & Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 22  号： 1  ページ： 375-390  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ここでは,カナリア諸島から流行する夜間の地上居住クモであるDysdera silvatica Schmidt,1981の染色体レベルゲノム集合を示した。Dysdera属は,主に栄養特殊化のレベルの変化に関連したこのアーカイペラゴにおいて顕著な多様化を受け,適応放射線のゲノム駆動因子を研究するための優れたモデルになった。新しい集合(1.37Gb;足場N50174.2Mb)を染色体立体配座捕捉足場技術を用いて行い,以前のバージョンに関して4500倍以上の連続性改善を示した。全集合サイズの87%をカバーする7つの最大の足場または偽染色体は,おそらく,特徴的な大きなX染色体を含むこの種の核型の7つの染色体に相当する。この新資源の価値を説明するために,2つの主要な節足動物化学受容体遺伝子ファミリー(すなわち,味覚およびイオン向性受容体)の包括的な解析を行った。X染色体において顕著な過小表現で,すべての偽染色体に分布する545の化学受容体配列を同定した。それらの少なくとも54%は83のゲノムクラスターに局在し,それらの間の平均よりも著しく低い進化距離を持ち,それらの多くの最近の起源を示唆する。この染色体レベル集合はSynspermiataクレードの最初の高品質ゲノム代表であり,クモの3番目であり,構造変異体,反復要素および大きな遺伝子ファミリーがクモの驚異的な生物学において演じる役割を含む,繊毛虫類ゲノムの構造と組織化への洞察を得るための新しい貴重な資源である。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 立体配座 ,  味覚 ,  *遺伝子 ,  *化学受容体 ,  *染色体 ,  *受容体 ,  *ゲノム ,  屈性 ,  クラスタ ,  捕獲 ,  モデル ,  *集合
準シソーラス用語： *カナリア諸島 ,  クレード ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： クモ類 ,  化学受容体 ,  染色体レベル集合 ,  Dysdera ,  遺伝子クラスタ ,  遺伝子族 ,  Hi-C

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (12件)： カナリア諸島 ,  固有 ,  クモ ,  Arachnida ,  クモ目 ,  染色体 ,  規模 ,  集合 ,  化学受容体 ,  遺伝子ファミリー ,  起源 ,  ゲノム構造