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J-GLOBAL ID：202202248742972290   整理番号：22A1028642

イタリアのイノシシ個体群のゲノム変異における歴史的ヒト操作に対する回復力【JST・京大機械翻訳】

Resilience to Historical Human Manipulations in the Genomic Variation of Italian Wild Boar Populations

著者 (10件)： Scandura Massimo (Department of Veterinary Medicine, University of Sassari, Sassari, Italy) ,  Fabbri Giulia (Department of Veterinary Medicine, University of Sassari, Sassari, Italy) ,  Caniglia Romolo (Unit for Conservation Genetics (BIO-CGE), Italian Institute for Environmental Protection and Research (ISPRA), Ozzano dell’Emilia, Italy) ,  Iacolina Laura (Faculty of Mathematics, Natural Sciences and Information Technologies, University of Primorska, Koper, Slovenia) ,  Iacolina Laura (Department of Chemistry and Bioscience, Aalborg University, Aalborg, Denmark) ,  Mattucci Federica (Unit for Conservation Genetics (BIO-CGE), Italian Institute for Environmental Protection and Research (ISPRA), Ozzano dell’Emilia, Italy) ,  Mengoni Chiara (Unit for Conservation Genetics (BIO-CGE), Italian Institute for Environmental Protection and Research (ISPRA), Ozzano dell’Emilia, Italy) ,  Pante Giulio (Department of Veterinary Medicine, University of Sassari, Sassari, Italy) ,  Apollonio Marco (Department of Veterinary Medicine, University of Sassari, Sassari, Italy) ,  Mucci Nadia (Unit for Conservation Genetics (BIO-CGE), Italian Institute for Environmental Protection and Research (ISPRA), Ozzano dell’Emilia, Italy)
資料名： Frontiers in Ecology and Evolution (Web)  (Frontiers in Ecology and Evolution (Web))
巻： 10  ページ： 833081  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7067A  ISSN： 2296-701X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 人間活動は,いくつかの動物種に対する生態学的,人口統計的および範囲摂動を決定する自然生態系を全体的に改変できる。これらの変化は,遺伝的均質化または逆に遺伝的に分岐したデームへの分割につながる異なる方法で,天然遺伝子プールを危うくする。過去数十年間,ほとんどのヨーロッパ野生イノシシ(Sus scrofa)個体群は,ヒトによって重度に管理された。人為的操作は,また,それらの元の遺伝子プールを深く改変する重い狩猟,転座および再導入を通して,イタリアの個体群に強く影響した。本研究では,良くマッピングされたブタゲノムの利用性を利用して,イタリアの野生イノシシ集団におけるゲノムワイド変動性を探索するためのゲノムツールを適用し,それらの遺伝的構造を調べ,国内ブタと非在来野生イノシシからの可能な遺伝子移入の特徴を検出した。Illumina Porcine SNP60 BeadChip(60k単一ヌクレオチド多型-SNP)を用いて,イタリア半島の6地域でサンプリングした134の野生イノシシからのゲノムデータを収集し,多変量および最尤法を用いて,ヨーロッパの検体および国内ブタ(市販およびイタリアの地方品種の両方)からの参照遺伝子型と比較した。ペアワイズF_ST値,多変量解析および帰属手順により,イタリアの個体群は,他の分析したヨーロッパの野生イノシシ個体群と高度に分化したことが示された。全体として,他のヨーロッパ地域よりもイタリア人集団において低いヘテロ接合性が見出された。Castelporziano Plandial Estate and Maremma地域公園における最も発散する個体群は,長期持続隔離の結果であり,個体群サイズと遺伝的ドリフトを減少させた。逆に,予想外の類似性は,高い距離でもApennin個体群間で見いだされた。非Italian野生イノシシと国内品種の両方からの移入の兆候は非常に限定された。要約するために,著者らは,イタリアの野生イノシシのゲノム多様性を初めて探索するために,ゲノムワイド手順を成功裏に適用し,それらが異なる個体群統計学と操作履歴を有するデームの非常に不均一な集団を表すことを示した。それにもかかわらず,我々の結果は,ゲノム変異の天然成分が,ほとんどの個体群において外因性のものより優勢であることを示唆する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多変量解析 ,  最尤法 ,  遺伝 ,  ヒト ,  ブタ ,  *ゲノム ,  品種 ,  *イノシシ ,  生態学 ,  *個体群 ,  摂動 ,  半島 ,  転座 ,  遺伝子導入 ,  一塩基多型

著者キーワード (8件)： Sus scrofa ,  SNP ,  固有多様性 ,  遺伝子構造 ,  添加剤 ,  ゲノム遺伝子移入 ,  転座 ,  野生ブタ

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (73件)：

• Alexander D. H., Novembre J., Lange K. (2009). Fast model-based estimation of ancestry in unrelated individuals. Genome Res. 19 1655-1664. doi: 10.1101/gr.094052.109
• Alexandri P., Megens H.-J., Crooijmans R. P. M. A., Groenen M. A. M., Goedbloed D. J., Herrero-Medrano J. M., et al (2017). Distinguishing migration events of different timing for wild boar in the Balkans. J. Biogeog. 44 259-270. doi: 10.1111/jbi.12861
• Allendorf F. W., England P. R., Luikart G., Ritchie P. A., Ryman N. (2008). Genetic effects of harvest on wild animal populations. Trends Ecol. Evol. 23 327-337. doi: 10.1016/j.tree.2008.02.008
• Apollonio M., Andersen R., Putman R. (2010a). European Ungulates and Their Management in the 21st century. Cambridge: Cambidge University Press. doi: 10.1016/j.tree.2008.02.008
• Apollonio M., Ciuti S., Pedrotti L., Banti P. (2010b). “"Ungulates and their management in Italy,"” in European Ungulates and Their Management in the 21st century, eds Apollonio M., Andersen R., Putman R. (Cambridge, UK: Cambridge University Press), 475-506. doi: 10.1016/j.tree.2008.02.008

タイトルに関連する用語 (7件)： イタリア ,  イノシシ ,  個体群 ,  ゲノム変異 ,  歴史 ,  ヒト ,  回復