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J-GLOBAL ID：202202248984025892   整理番号：22A0947469

血小板減少症症候群ウイルスによる重症熱の遺伝的進化とコドン使用パターン【JST・京大機械翻訳】

The genetic evolution and codon usage pattern of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus

著者 (9件)： Zu Zhipeng (Department of Epidemiology, School of Public Health, and the Key Laboratory of Public Health Safety of Ministry of Education, Fudan University, Shanghai 200032, China) ,  Lin Haijiang (Department of Epidemiology, School of Public Health, and the Key Laboratory of Public Health Safety of Ministry of Education, Fudan University, Shanghai 200032, China) ,  Lin Haijiang (Taizhou City Center for Disease Control and Prevention, Taizhou City, Zhejiang Province 318001, China) ,  Hu Yafei (Taizhou City Center for Disease Control and Prevention, Taizhou City, Zhejiang Province 318001, China) ,  Zheng Xiang (Taizhou City Center for Disease Control and Prevention, Taizhou City, Zhejiang Province 318001, China) ,  Chen Cairong (Taizhou City Center for Disease Control and Prevention, Taizhou City, Zhejiang Province 318001, China) ,  Zhao Yishuang (Taizhou City Center for Disease Control and Prevention, Taizhou City, Zhejiang Province 318001, China) ,  He Na (Department of Epidemiology, School of Public Health, and the Key Laboratory of Public Health Safety of Ministry of Education, Fudan University, Shanghai 200032, China) ,  He Na (Shanghai Institute of Infectious Diseases and Biosecurity, Fudan University, Shanghai 200032, China)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 99  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 血小板減少症症候群(SFTS)を伴う重症熱は,最近,東アジアで連続的に循環しているSFTSウイルス(SFTSV)に起因する新たに出現した伝染性感染症である。SFTSVの進化は研究されているが,コドン使用に関連した進化的変化は報告されていない。したがって,SFTSVの包括的な遺伝的およびコドン使用バイアス解析を実施し,新規展望における遺伝的多様性および進化関係を解明した。2020年に中国東部,浙江省の県から15のSFTSV株を増幅し,配列決定し,SFTS事例を過去10年間連続的に報告した。SFTSVセグメントの完全コーディング配列に基づいて系統解析を行った。それは,浙江省で循環するすべてのSFTSV菌株が,2つの異なる遺伝子型に属する日本と韓国の株でクラスタ化されたことを示唆した。一方,41のSFTSV菌株における45の組換え事象が見つかった間,19の異なる再集合形態に分類された39の遺伝子再集合を同定した。遺伝子型と宿主との関係における進化的変化を理解するために,Codon利用パターンをさらに分析した。そして,コドン使用バイアスは主に突然変異圧力よりむしろ自然選択によって駆動されることを明らかにした。加えて,コドン適応指数(CAI)分析は,SFTSVのGallusガラスとホモサピエンスへの強い適応性を示した。類似性指数(SiD)分析は,Haemaphysalis longicornisがSFTSVに対する強い選択圧を与えることを示した。結論として,本研究はSFTSVの遺伝的多様性が徐々に増加していることを明らかにした。コドン利用分析は,SFTSVのコドン使用バイアスが主に自然選択により駆動され,SFTSVが宿主特異的コドン使用パターン進化を進化させることを示唆した。これはSFTSVに対する制御対策の開発に寄与する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ウイルス ,  *遺伝 ,  遺伝子型 ,  *コドン ,  突然変異 ,  ヒト ,  クラスタ化 ,  自然淘汰 ,  *血小板減少症
準シソーラス用語： Gallus ,  フタトゲチマダニ ,  系統解析 ,  選択圧 ,  重症熱性血小板減少症候群 ,  重症熱性血小板減少症候群ウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 血小板減少症候群ウイルスによる重症熱 ,  Dabie bandavirus ,  系統発生 ,  組換え ,  再集合 ,  Codon使用バイアス

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (6件)： 血小板減少症 ,  症候群 ,  ウイルス ,  重症 ,  進化 ,  コドン