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J-GLOBAL ID：202202249347240881   整理番号：22A0944781

最大南アメリカ首都圏から回収したシプロフロキサシン耐性Neisseria gonorrhoeae分離株のゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Genomic analyses of ciprofloxacin-resistant Neisseria gonorrhoeae isolates recovered from the largest South American metropolitan area

著者 (15件)： Cassu-Corsi Dandara (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Santos Fernanda F. (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Cayo Rodrigo (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Cayo Rodrigo (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio de Bacteriologia e Imunologia (LIB), Setor de Biologia Molecular, Microbiologia e Imunologia, Departamento de Ciencias Biologicas (DCB), Instituto de Ciencias Ambientais, Quimicas e Farmaceuticas (ICAQF), Diadema, SP, Brazil) ,  Martins Willames M.B.S. (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Nodari Carolina S. (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Almeida Luiz G.P. (Laboratorio Nacional de Computacao Cientifica (LNCC), Petropolis, RJ, Brazil) ,  Martins Rafael A. (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Carvalho da Silva Roberto J. (Centro de Referencia e Treinamento de Doencas Sexualmente Transmissiveis (CRT/AIDS), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Vasconcelos Ana Tereza R. (Laboratorio Nacional de Computacao Cientifica (LNCC), Petropolis, RJ, Brazil) ,  Pignatari Antonio C.C. (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Pignatari Antonio C.C. (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio Especial de Microbiologia Clinica (LEMC), Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Gales Ana C. (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Gales Ana C. (Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP), Laboratorio Especial de Microbiologia Clinica (LEMC), Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil) ,  Cassu-Corsi Dandara (Programa de Pos Graduacao em Medicina Translacional, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), Sao Paulo, SP, Brazil)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 114  号： 2  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ブラジル,サンパウロの都市域で12年間にわたって回復する異なる感受性プロファイルを示す13のNeisseria gonorrhoeae分離株を配列決定した。全ゲノム配列決定(WGS)を,Illumina MiSeq 2×300bpペアエンド読取で実施した。CGE,PATRIC,およびBLASTデータベースを用いてバイオインフォマティクス分析を行い,得られたゲノムの手動キュレーションを行った。多遺伝子座配列タイピング(MLST)分析は,7つのSTs,すなわち,ST1580,ST1590,ST1901,ST1902,ST8161,ST9363,およびST15640を同定した。さらに,変異の多様性はMtrR/G45D-A39T,PIB/G120K-A121S,およびPBP1/L421Pで観察された。スルホンアミド(DHPS/R228S)とリファンピシン(RNAP/H552N)に関連する変異も,テトラサイクリン耐性決定因子,すなわちrpsJ/V57Mとtet(M)と同様に検出した。ここに示した結果はブラジル,サンパウロで循環するN.gonorrhoeae株の知識に寄与する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *微生物 ,  ヌクレオチド配列 ,  薬物耐性 ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  都市域 ,  *淋菌 ,  脂環式化合物 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族フッ素化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  ケト酸
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  テトラサイクリン耐性 ,  BLAST ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノム配列 ,  多座位配列タイピング ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 淋菌 ,  淋漏 ,  マクロライド ,  フルオロキノロン ,  ST90/CC90 ,  系統発生解析

分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  微生物生理一般  (EG03051L)

物質索引 (1件)： シプロフロキサシン

タイトルに関連する用語 (7件)： 南アメリカ ,  首都圏 ,  シプロフロキサシン ,  耐性 ,  Neisseria ,  分離株 ,  ゲノム解析