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J-GLOBAL ID：202202250371584597   整理番号：22A1058224

免疫情報科学と分子動力学シミュレーションアプローチを適用したSARS-CoV-2に対するマルチエピトープワクチン【JST・京大機械翻訳】

Multi-epitope vaccine against SARS-CoV-2 applying immunoinformatics and molecular dynamics simulation approaches

著者 (3件)： Jyotisha (Department of Biotechnology and Bioinformatics, School of Life Sciences, University of Hyderabad, Hyderabad, Telangana, India) ,  Singh Samayaditya (Department of Biotechnology and Bioinformatics, School of Life Sciences, University of Hyderabad, Hyderabad, Telangana, India) ,  Qureshi Insaf Ahmed (Department of Biotechnology and Bioinformatics, School of Life Sciences, University of Hyderabad, Hyderabad, Telangana, India)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 7  ページ： 2917-2933  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： SARS-CoV-2によって引き起こされるCOVID-19は,非常に短いスパンで世界中で数百万の死亡に至る重度の呼吸器疾患である。高い症例死亡率と医療対応策の欠如は,安全で効果的なワクチンを開発する緊急の探求を強調する。SARS-CoV-2のスパイク蛋白質の受容体結合ドメイン(RBD)は,ウイルス付着と侵入のためにヒト宿主細胞上のACE2受容体に結合し,従ってワクチン,抗体および治療法を開発するための重要な標的と考えられている。本研究では,免疫情報学アプローチを用いて,SARS-CoV-2スパイク蛋白質のRBDを用いて新規マルチエピトープワクチンを設計した。潜在的B-およびT-細胞エピトープを,ワクチン構築物を設計するために,様々なバイオインフォマティクスツールを用いてRBD配列から選択した。in silico設計したマルチエピトープワクチンは,アジュバント(ヒトβ-デフェンシン-2)を有する146アミノ酸を含み,さらに,抗原性,アレルゲン性,および安定性を含むいくつかのパラメータについて計算的に評価した。続いて,ワクチン構築物の三次元構造をモデル化し,次に,種々のtoll様受容体とドッキングさせた。ドッキングしたTLR3-ワクチン複合体の分子動力学(MD)研究は,シミュレーション時間中に高度に安定であり,相互作用の安定化は静電エネルギーにより大きく寄与した。ドッキング複合体はまた,動力学中の残基の動きにおいて低い変形と剛性の増加を示した。さらに,マルチエピトープワクチンのin silicoクローニングを行い,細菌系における発現のためのプラスミド構築物を作成した。まとめると,著者らの研究は,RBD領域を含む設計されたワクチン候補が,Ramswamy H.Sarmaによって免疫されたSARS-CoV-2に対する特異的体液性および細胞媒介免疫応答を提供できることを示唆する。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  ドッキング ,  細菌 ,  生物学 ,  抗体 ,  受容体 ,  ヒト ,  *免疫 ,  免疫反応 ,  *ワクチン ,  結合部位 ,  複合体 ,  免疫原性 ,  T細胞 ,  *エピトープ
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： SARS-CoV-2 ,  受容体結合ドメイン ,  免疫情報的アプローチ ,  マルチエピトープワクチン ,  分子動力学シミュレーション

分類 (3件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  感染免疫  (ED03030P) ,  免疫療法薬・血液製剤の基礎研究  (GW22010D)

タイトルに関連する用語 (4件)： 免疫 ,  情報科学 ,  分子動力学シミュレーション ,  SARS-CoV-2