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J-GLOBAL ID：202202250584846071   整理番号：22A0445401

in silicoツールを用いたTEF[Eragrostis tef(Zucc.)Trotter]からのVOZS同定は非生物的ストレスへの関与を解読する【JST・京大機械翻訳】

VOZS identification from TEF [Eragrostis tef (Zucc.) Trotter] using in silico tools decipher their involvement in abiotic stress

著者 (4件)： Mulat Mikias Wondimu (Department of Biotechnology, School of Engineering and Technology, Sharda University, Greater Noida, UP 201310, India) ,  Mulat Mikias Wondimu (Department of Plant Sciences, College of Agriculture, Wollo University, Dessie, Amhara State, Ethiopia) ,  Sinha Vimlendu Bhushan (Department of Biotechnology, School of Engineering and Technology, Sharda University, Greater Noida, UP 201310, India) ,  Sinha Vimlendu Bhushan (Registrar Office, Administrative Building, Rani Lakshmi Bai Central Agricultural University, Jhansi 284003, India)
資料名： Materials Today: Proceedings  (Materials Today: Proceedings)
巻： 49  号： P8  ページ： 3357-3364  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3531A  ISSN： 2214-7853  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Eragrostisテフは,気候の変化に対する栄養的利益とレジリエンスにより人気を得ている。維管束植物1亜鉛フィンガー(VOZ)は,非生物的および生物的ストレスに関連する様々な応答および過程に関与する植物特異的転写因子である。牧草におけるVOZsの包括的な研究に対して,試みがなされてきた。ArabidopsisとイネVOZsをCoGeBlastで用いて,テフから同定された4つのVOZsを得た。テフからのVOZsは,MEGA X,MEME,PLANTCAREおよびSTRINGのような異なるバイオ情報ツールを用いて,モチーフ,ドメイン,進化経路およびネットワークを見つけるためのin silico分析を受けた。テフからのVOZは,異なる染色体3および9に位置することを見出した。VOZの局在は,核,細胞質および小胞体における分布を明らかにした。発見された保存モチーフはVOZの基本特性である3つのCyst-Hist残基を示した。Majorクラスタ化は,亜ゲノム間のオルソロジーと相同性を有する16の草に由来する43の配列の間で形成された。上流分析は,ストレスに対する光感受性とホルモン調節で機能することが知られている様々なCREsを明らかにした。蛋白質会合ネットワーク分析は,E.tefとS.italica,P.virgatumとS.bicolorの間の高い同一性を示し,inerologs関係が蛋白質-蛋白質相互作用をシミュレートできることを示唆した。本研究は,Eragrostisテフと牧草におけるVOZの機能的および構造的役割のより深い寄与を助ける。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  牧草 ,  気候 ,  小胞体 ,  タンパク質 ,  クラスタ化 ,  ゲノム ,  相同性 ,  *転写因子 ,  Arabidopsis
準シソーラス用語： 亜鉛フィンガー ,  オルソログ ,  ドメイン構造 ,  *非生物的ストレス ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 血管植物1亜鉛フィンガー(VOZ) ,  転写因子 ,  Eragrostisテフ ,  in silico

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (6件)： ツール ,  TEF ,  Eragrostis ,  同定 ,  非生物的ストレス ,  解読