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J-GLOBAL ID：202202250772316153   整理番号：22A0216362

ヒトGMPR酵素のGMPまたはIMP結合部位における水分子の動力学への新しい生化学的洞察:分子動力学研究【JST・京大機械翻訳】

New biochemical insights into the dynamics of water molecules at the GMP or IMP binding site of human GMPR enzyme: A molecular dynamics study

著者 (4件)： Bairagya Hridoy R. (Department of Chemistry, University of Cambridge, Cambridge, UK) ,  Tasneem Alvea (Department of Computer Science, Jamia Millia Islamia, New Delhi, India) ,  Rai Gyan Prakash (Department of Computer Science, Jamia Millia Islamia, New Delhi, India) ,  Reyaz Saima (Department of Computer Science, Jamia Millia Islamia, New Delhi, India)
資料名： Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics  (Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics)
巻： 90  号： 1  ページ： 200-217  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0761A  ISSN： 0887-3585  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトGMPレダクターゼ(hGMPR)酵素は細胞代謝経路に関与し,GMPをIMPに変換し,抗白血病薬の重要な標的でもある。分子動力学シミュレーションを用いてGMPからIMPへの立体配座転移過程中の水分子の動的挙動を説明した。癌性蛋白質(PDB Id.2C6Q)の基質結合部位の残基は,通常蛋白質(PDB Id.2BLE)よりも自然界で多く動的である。19の保存水分子をGMP/IMP結合部位で同定し,(i)保存安定動的および(ii)まれな動的に分類する。水分子W11,W14,およびW16は,それらの不動特性により保存された安定動的として分類されるが,残りの水分子(W1,W2,W3,W4,W5,W7,W8,W9,W10,W12,W13,W15,W17,W18,およびW19)は,動的性質でまれである。GMP/IMP部位でのこれらのまれな水分子の侵入または変位は,リガンドを含む参照残基の前方および後方移動により起こる可能性がある。hGMPR-Iの4つの水分子とhGMPR-IIの9つの水分子がGMPからIMP経路への反復転移で観察され,hGMPRsの2つのイソ型間の識別を示した。癌蛋白質中の水分子は,正常蛋白質と比較してより動的で不安定である。これらの水分子はGMP結合部位で稀な動的事象を遂行し,hGMPRの生物学的機能性に影響する立体配座転移の詳細な理解を助けることができた。この研究は,CML癌に対する白血病研究および薬剤発見に関わる実験コミュニティーに興味がある。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *酵素 ,  配座転移 ,  タンパク質 ,  白血病 ,  ヒト ,  *結合部位 ,  生物活性 ,  *水分子 ,  *分子動力学 ,  癌タンパク質
準シソーラス用語： 白血病治療薬 ,  分子動力学シミュレーション ,  細胞代謝 ,  基質結合部位 ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 保存水分子 ,  動力学 ,  GMP/IMP結合部位 ,  hGMPR酵素 ,  MDシミュレーション

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (11件)： ヒト ,  酵素 ,  GMP ,  IMP ,  結合部位 ,  水分子 ,  動力学 ,  生化学 ,  洞察 ,  分子動力学 ,  研究