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J-GLOBAL ID：202202250790821546   整理番号：22A1081109

増強サンプリングシミュレーションによるGTP加水分解中のKRasの機能的サブ状態の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of functional substates of KRas during GTP hydrolysis with enhanced sampling simulations

著者 (6件)： Zeng Juan (School of Biomedical Engineering, Guangdong Medical University, Dongguan 523808, China) ,  Chen Jian ,  Xia Fei ,  Cui Qiang ,  Deng Xianming ,  Xu Xin
資料名： Physical Chemistry Chemical Physics  (Physical Chemistry Chemical Physics)
巻： 24  号： 13  ページ： 7653-7665  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0271C  ISSN： 1463-9076  CODEN： PPCPFQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 主要なシグナル伝達経路のハブとして,Ras蛋白質は,それらの立体配座および/または触媒特性の摂動により,腫瘍起因癌の19%に関与する。多くの研究にもかかわらず,最も重要なイソ型,KRasに対する立体配座サブ状態の機能は,不明のままである。本研究では,GTP加水分解サイクル中の種々の化学状態におけるKRaの立体配座景観に関する広範なシミュレーション解析を行った:反応物状態KRasGTPMg2+,中間状態KRasGDPPiMg2+,および生成物状態K_RasGDPMg2+。増強サンプリングシミュレーションの結果は,KRasGTPMg2+の状態1が溶液中で複数の安定なサブ状態を持ち,その1つはGEFとの相互作用を説明するかもしれないことを明らかにした。KRasGTP/Mg2+の状態2は2つのサブ状態「Tyr32_in」と「Tyr32_out」を特徴とし,それぞれエフェクターとGAPと相互作用する。中間状態KRasGDP(Pi)Mg2+に対して,Gln61とPiは,HRasとNRasの状況とは対照的に,KRasにおけるGln61変異の弱い発癌効果を説明するかもしれない,広範囲の立体配座を仮定することを見出した。最後に,生成物状態KRasGDP(Mg2+)は溶液中で2つの安定なサブ状態を持ち,GEFとの錯化のための立体配座選択機構を示す。これらの結果に基づいて,GTP加水分解中のKRasの高エネルギーサブ状態の結合部位を標的化するためのいくつかの特異的阻害戦略を議論した。Copyright 2022 Royal Society of Chemistry All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *シミュレーション ,  相互作用 ,  中間状態 ,  立体配座 ,  エネルギー ,  *加水分解 ,  錯体生成 ,  腫瘍 ,  発癌 ,  結合部位 ,  ターゲティング ,  Rasタンパク質
準シソーラス用語： アイソフォーム ,  高エネルギー ,  反応物 ,  触媒特性 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子間相互作用  (BH07020P) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： 増強 ,  サンプリング ,  シミュレーション ,  GTP ,  加水分解 ,  KRAS ,  サブ ,  同定