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J-GLOBAL ID：202202251202022725   整理番号：22A0968072

コロナウイルス2019および肺腺癌患者の共通遺伝子シグネチャを同定するためのバイオインフォマティクスアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics approach to identify common gene signatures of patients with coronavirus 2019 and lung adenocarcinoma

著者 (3件)： Liang Xiao (Department of Anesthesiology, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan Province, China) ,  Chen Yali (Department of Anesthesiology, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan Province, China) ,  Fan Yuchao (Department of Anesthesiology, Sichuan Cancer Center, Sichuan Cancer Hospital & Institute, School of Medicine, University of Electronic Science and Technology of China, Chengdu, Sichuan Province, China)
資料名： Environmental Science and Pollution Research  (Environmental Science and Pollution Research)
巻： 29  号： 15  ページ： 22012-22030  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4325A  ISSN： 0944-1344  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コロナウイルス病2019(COVID-19)は,世界的流行として継続している。COVID-19に感染した肺癌患者は重症疾患または死亡を発症する可能性がある。そのような患者を治療することは,圧倒的に圧倒的なヘルスケアシステムを負担する。ここでは,COVID-19と肺腺癌(LUAD)患者の間で共有される潜在的病理機構を同定した。COVID-19およびLUAD患者における共発現,差次的発現遺伝子(DEG)を同定し,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを構築し,濃縮分析を行うために使用した。ネットワークAnalystプラットフォームを用い,共発現DEGの共調節を確立し,Spearman相関を用い,免疫浸潤および免疫チェックポイントとハブ遺伝子の会合の重要性を評価した。3つのデータセットの解析は,蛋白質-PPIネットワークを構築するために使用された112の共有DEGを同定した。その後の濃縮分析は,生物学的プロセス(BP),分子機能(MF),および細胞成分(CC),ならびに経路,特異的器官,細胞,および疾患に関連する共発現遺伝子を明らかにした。10の共発現ハブ遺伝子を用いて,遺伝子-miRNA,転写因子(TF)-遺伝子,およびTF-miRNAネットワークを構築した。Hub遺伝子は免疫浸潤および免疫チェックポイントと有意に関連していた。最後に,LUADにおけるハブ遺伝子のメチル化レベルをUALCANデータベースにより得た。本多次元研究は,COVID-19およびLUAD患者による特異的遺伝子発現における共通性を明らかにした。これらの知見は,COVID-19によるLUAD患者の管理と治療を最適化するための開発戦略への洞察を提供する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *情報科学 ,  データベース ,  ネットワーク ,  浸潤 ,  メチル化 ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  遺伝子発現 ,  肺腫瘍 ,  *腺癌 ,  病理 ,  転写因子
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *肺腺癌 ,  *バイオインフォマティクス ,  共発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： COVID-19 ,  SARS-CoV-2 ,  肺腺癌 ,  差次的発現遺伝子 ,  生物情報学 ,  遺伝子調節ネットワーク

分類 (3件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： コロナウイルス ,  肺腺癌 ,  患者 ,  遺伝子 ,  シグネチャ ,  同定