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J-GLOBAL ID：202202252899087286   整理番号：22A0003952

特異的ヒ素曝露農村被験者の血液エピゲノム応答とSNPsベース遺伝的危険因子の統合は疾患関連シグナル伝達経路を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Integrating SNPs-based genetic risk factor with blood epigenomic response of differentially arsenic-exposed rural subjects reveals disease-associated signaling pathways

著者 (7件)： Rehman Muhammad Yasir Abdur (Environmental Health Laboratory, Department of Environmental Sciences, Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Briede Jacco Jan (Department of Toxicogenomics, GROW School for Oncology and Developmental Biology, Maastricht University, the Netherlands) ,  van Herwijnen Marcel (Department of Toxicogenomics, GROW School for Oncology and Developmental Biology, Maastricht University, the Netherlands) ,  Krauskopf Julian (Department of Toxicogenomics, GROW School for Oncology and Developmental Biology, Maastricht University, the Netherlands) ,  Jennen Danyel G.J. (Department of Toxicogenomics, GROW School for Oncology and Developmental Biology, Maastricht University, the Netherlands) ,  Malik Riffat Naseem (Environmental Health Laboratory, Department of Environmental Sciences, Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Kleinjans Jos C.S. (Department of Toxicogenomics, GROW School for Oncology and Developmental Biology, Maastricht University, the Netherlands)
資料名： Environmental Pollution  (Environmental Pollution)
巻： 292  号： PA  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： D0984B  ISSN： 0269-7491  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 地下水中のヒ素(As)汚染は,数百万の人々の間で多くの有害な健康結果の原因である。エピジェネティック変化はAs毒性の最も広く研究されている機構である。As曝露が後成的修飾を介して遺伝子発現を変化させるかを理解するために,パキスタンの飲用水As曝露農村被験者のメチロームに及ぼすAs曝露に関連した多重重要な一塩基多型(SNP)の影響に取り組むために,系統的ゲノムワイド研究を設計した。尿中Asレベルを用いて,被験者を低,中および高曝露群に分類した。ゲノムワイドDNAメチル化を,NimbleGen2.1M Deruxe Proモーターアレイと組み合わせたMeDIPを用いて調べた。トランスクリプトームレベルはAgilent 8×60K発現配列を用いて測定した。選択したSNP(As3MT,DNMT1a,ERCC2,EGFRおよびMTHFR)の遺伝子型決定を測定し,既知のリスク対立遺伝子数に基づいて測定した遺伝子型に特異的値を割り当てることによって,各回答者に対する統合遺伝的危険因子を計算した。As曝露に関連した代表的モデルを選択するために,モデル1(遺伝的リスク因子を含む),モデル2(遺伝的リスク因子のない)およびメチロームデータに組み込まれた個々のSNPを含むモデルから成る9つの線形混合モデルを比較した。経路分析はConsensusPathDBを用いて行った。統合遺伝的リスク因子を含むモデル1は,低および高メチル化遺伝子標的と会合して,筋収縮,心臓血管疾患,ATRシグナリング,GPCRシグナリング,メチオニン代謝およびクロマチン修飾を含む生化学的経路を明らかにした。ユニークな経路(直接P53エフェクター)は,CSE1LとTRRAPの高メチル化による個々のDNMT1a多型と関連することを見出した。最も重要なことに,ATR,ATF7IP,TPM3,UBE2J2の遺伝子発現との関連で,As関連DNAメチル化の最初の証拠を示した。SNPデータをメチロームデータと統合した最初の証拠は,より代表的なエピゲノムプロファイルを生成し,As曝露個体の疾患リスクにおけるより良い洞察を明らかにする。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ヒ素 ,  メチル化 ,  遺伝子型 ,  心血管疾患 ,  *農村 ,  飲用水 ,  対立遺伝子 ,  遺伝子発現 ,  遺伝子ターゲティング ,  *危険因子 ,  *一塩基多型 ,  トランスクリプトーム ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  *エピゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ヒ素 ,  エピゲノム ,  SNP ,  危険因子 ,  経路 ,  飲用水 ,  パキスタン

分類 (1件)： 重金属とその化合物一般  (SB05021R)

タイトルに関連する用語 (12件)： ヒ素 ,  曝露 ,  農村 ,  被験者 ,  血液 ,  エピゲノム ,  応答 ,  SNPs ,  遺伝的危険因子 ,  統合 ,  疾患 ,  シグナル伝達経路