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J-GLOBAL ID：202202252981973064   整理番号：22A0217055

Photobacterium damselae subsp. damselae感染に対するSebastes schlegeliにおける免疫応答の脾臓トランスクリプトームの比較分析【JST・京大機械翻訳】

Comparative analysis of spleen transcriptome of immune response in Sebastes schlegeli against Photobacterium damselae subsp. damselae infection

著者 (16件)： Yu Yongxiang (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Yu Yongxiang (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Wang Yingeng (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Wang Yingeng (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Liao Meijie (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Liao Meijie (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Shi Linni (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Li Yongjie (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Li Bin (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Li Bin (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Rong Xiaojun (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Rong Xiaojun (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Wang Chunyuan (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Wang Chunyuan (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Zhang Zheng (Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academic of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Zhang Zheng (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China)
資料名： Aquaculture Research  (Aquaculture Research)
巻： 53  号： 1  ページ： 232-242  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1286A  ISSN： 1355-557X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： これまでの研究は,Photobacterium damselae subsp.damselae(Pdd)が,重度の皮膚潰瘍症状を有する黒いキンギョ(Sebastes schlegeli)の病原体であることを示した。本研究は,Pdd感染後の24時間(P24群)と48時間(P48群)でのS.schlegeliの脾臓トランスクリプトーム応答を調べ,免疫関連遺伝子の発現プロファイルを特性化した。対照群の魚には,PBSの等しい体積を注射した。結果は,PBS対P24,PBS対P48およびP24対P48において,それぞれ2,139(88.42%),510(21.08%)および242(10%)の差次的発現遺伝子があることを示した。時間が増加するにつれて,差次的遺伝子の数は徐々に減少した。GOアノテーションは,免疫関連機能カテゴリーが,免疫応答,免疫系プロセス,免疫エフェクタープロセスおよび免疫システムプロセスの調節を含む,PBS対P24およびPBS対P48群に最も寄与することを示した。KEGG濃縮分析は,これらの遺伝子がPBS対P24,PBS対P48およびP24対P48群でそれぞれ277,184および164シグナル伝達経路に位置することを示した。それらの間で,30,26および16の経路は,344,119および24の遺伝子を含む免疫系に関連していた。P24群は,P48群より多くの免疫関連シグナル経路と遺伝子を含んだ。RT-qPCR検証は,異なる時点における10遺伝子の発現パターンがRNA-Seq解析と良く一致することを示した。本研究はS.schlegeliにおける光細菌症に対する分子応答のより良い理解を提供した。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *脾臓 ,  *免疫反応 ,  細菌感染症 ,  キンギョ ,  *発光菌属 ,  病原体 ,  アノテーション ,  *トランスクリプトーム ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 免疫系 ,  KEGG ,  差次的遺伝子発現 ,  遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 免疫応答 ,  Photobacterium damselae subsp.damselae ,  Sebastes schlegeli ,  脾臓 ,  トランスクリプトーム

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  魚類  (FH02020K) ,  免疫反応一般  (ED03010T)

タイトルに関連する用語 (6件)： Photobacterium ,  感染 ,  免疫応答 ,  脾臓 ,  トランスクリプトーム ,  比較分析