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J-GLOBAL ID：202202253234265581   整理番号：22A0496443

遺伝子発現プロファイルのバイオインフォマティクス解析は,皮膚エリテマトーデスに関与する重要な遺伝子および機能経路を同定する【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analyses of gene expression profile identify key genes and functional pathways involved in cutaneous lupus erythematosus

著者 (20件)： Gao Zhen-yu (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Gao Zhen-yu (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Su Lin-chong (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Su Lin-chong (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Wu Qing-chao (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Wu Qing-chao (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Sheng Jiao-e (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Sheng Jiao-e (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Wang Yun-long (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Wang Yun-long (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Dai Yu-fang (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Dai Yu-fang (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Chen An-ping (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Chen An-ping (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  He San-shan (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  He San-shan (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Huang Xia (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Huang Xia (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Yan Guo-qing (Department of Rheumatology and Immunology, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China) ,  Yan Guo-qing (Hubei Provincial Key Laboratory of Occurrence and Intervention of Rheumatic Disease, The Affiliated Hospital of Hubei Minzu University, Enshi, Hubei Province, China)
資料名： Clinical Rheumatology  (Clinical Rheumatology)
巻： 41  号： 2  ページ： 437-452  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4168A  ISSN： 0770-3198  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:Lupus erythrobacteriaは皮膚病変から全身症状までの複数の臓器に損傷を引き起こす自己免疫疾患である。皮膚エリテマトーデス(CLE)はエリテマトーデス(LE)の共通型であるが,その分子機構は現在知られていない。この研究は遺伝子発現プロファイルの変化を調べ,CLEに関与する重要な遺伝子を同定し,その分子機構を明らかにし,CLEの新しい標的を同定することを目的とした。方法:CLE皮膚病変のトランスクリプトームプロファイリングである遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースに由来するマイクロアレイデータセット(GSE109248)を分析した。差次的発現遺伝子(DEG)を同定し,DEGの機能的アノテーションを遺伝子オントロジー(GO)と遺伝子およびゲノム(KEGG)経路濃縮分析の京都エンシクロペディアで行った。蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークも構築し,CLEに関与するハブ遺伝子を同定した。結果:合計755の上方制御されたDEGと405の下方制御されたDEGを同定した。GO濃縮分析は,ウイルスに対する防御応答,免疫応答およびI型インターフェロンシグナリング経路がDEGにおける最も重要な濃縮項目であることを示した。KEGG経路分析は,主に全身性エリテマトーデス,破骨細胞分化,サイトカイン-サイトカイン受容体相互作用,および原発性免疫不全を含む51の有意な濃縮経路を同定した。PPIネットワークに基づいて,研究はCLEに関与するトップ10ハブ遺伝子を同定し,それはCXCL10,CCR7,FPR3,PPARGC1A,MMP9,IRF7,IL2RG,SOCS1,ISG15,およびGSTM3であった。サブタイプ間の比較によって,結果は,ACLEが最小のDEGを持ち,一方,CCLEが大部分の遺伝子と機能的変化を示したことを示した。結論:本研究で見出された同定されたハブ遺伝子と機能的経路は,CLEの根底にある病因に関する我々の理解を広げ,CLEの診断と治療のための潜在的バイオマーカーまたは標的への新しい洞察を提供する。Copyright International League of Associations for Rheumatology (ILAR) 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  免疫反応 ,  皮膚障害 ,  *エリテマトーデス ,  *遺伝子発現 ,  免疫不全症候群 ,  サイトカイン ,  バイオマーカー ,  病因 ,  アノテーション ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 分子機構 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： バイオインフォマティクス解析 ,  皮膚エリテマトーデス ,  免疫応答 ,  病原性

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  免疫性疾患・アレルギー性疾患一般  (GD04010C)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子発現プロファイル ,  バイオインフォマティクス解析 ,  皮膚エリテマトーデス ,  遺伝子 ,  経路 ,  同定