文献

J-GLOBAL ID：202202253274821592   整理番号：22A1178543

Rhodiola crenulataにおけるRcMYB遺伝子のゲノムワイド同定と発現解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide Identification and Expression Analysis of RcMYB Genes in Rhodiola crenulata

著者 (8件)： Xu Binjie (1Key Laboratory of Southwestern Chinese Medicine Resources, Innovative Institute of Chinese Medicine and Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, China) ,  Xu Binjie (2China Resources Sanjiu (Ya’an) Pharmaceutical Co., Ltd., Ya’an, China) ,  Chen Bang (3School of Medical Technology, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, China) ,  Qi Xiaoli (3School of Medical Technology, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, China) ,  Liu Shunli (3School of Medical Technology, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, China) ,  Zhao Yibing (3School of Medical Technology, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, China) ,  Tang Ce (1Key Laboratory of Southwestern Chinese Medicine Resources, Innovative Institute of Chinese Medicine and Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, China) ,  Meng Xianli (1Key Laboratory of Southwestern Chinese Medicine Resources, Innovative Institute of Chinese Medicine and Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 13  ページ： 831611  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 現代の研究は,広範囲の薬用価値を有するRhodiola crenulataの主要な薬用成分が,その二次代謝産物サリドロシドであることを立証した。MYB転写因子ファミリーは,植物におけるストレス応答における二次代謝および他の役割の生合成に広く関与しており,R.crenulataにおけるこのファミリーのゲノムワイド同定および分析は,導電性である。本研究では,ゲノムワイド解析により,R.crenulataゲノムにおける保存ドメインに基づく139MYB遺伝子を同定し,137遺伝子を用いて系統樹を構築し,発現ファイルで修飾して進化特性を明らかにした。物理的および化学的特性,遺伝子構造,および保存されたモチーフ分析も用いて,RcMYBをさらに分析した。さらに,転写,ホルモンおよびMYB結合に関連するシス作用要素を,選択したRcMYBのプロモーター領域において見出した。4つのRcMYBをクローン化し,配列決定し,それらの遺伝子発現パターンをそれらの機能の更なる分析のために分析した。研究結果は,RcMYBとR.crenulataの機能に関する更なる研究のための基礎を築いた。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 応答 ,  分子構造 ,  生合成 ,  *遺伝子 ,  ホルモン ,  系統樹 ,  *ゲノム ,  プロモーター領域 ,  クローン ,  転写因子 ,  二次代謝産物 ,  導電性
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  ドメイン構造 ,  遺伝子構造 ,  二次代謝 ,  遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Rhodiola crenulata ,  MYB転写因子ファミリー ,  ゲノムワイド同定 ,  遺伝子発現解析 ,  WGCNA解析

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (55件)：

• AmbawatS., SharmaP., YadavN. R., YadavR. C. (2013). MYB Transcription Factor Genes as Regulators for Plant Responses: An Overview. Physiol. Mol. Biol. Plants 19 (3), 307-321. doi: 10.1007/s12298-013-0179-1
• AnY., DaiX., ZhangW.-H. (2012). A R2R3-Type MYB Gene, OsMYB2, Is Involved in Salt, Cold, and Dehydration Tolerance in rice. J. Exp. Bot. 63 (7), 2541-2556. doi: 10.1093/jxb/err431
• BallesterA.-R., MolthoffJ., de VosR., HekkertB. t. L., OrzaezD., Fernaݩndez-MorenoJ.-P., et al (2010). Biochemical and Molecular Analysis of Pink Tomatoes: Deregulated Expression of the Gene Encoding Transcription Factor SlMYB12 Leads to Pink Tomato Fruit Color. Plant Physiol. 152 (1), 71-84. doi: 10.1104/pp.109.147322
• BiH., LuangS., LiY., BazanovaN., MorranS., SongZ., et al (2016). Identification and Characterization of Wheat Drought-Responsive MYB Transcription Factors Involved in the Regulation of Cuticle Biosynthesis. J. Exp. Bot. 67 (18), 5363-5380. doi: 10.1093/jxb/erw29810.1093/jxb/erw298
• ButtH. I., YangZ., GongQ., ChenE., WangX., ZhaoG., et al (2017). GaMYB85, an R2R3 MYB Gene, in Transgenic Arabidopsis Plays an Important Role in Drought Tolerance. BMC Plant Biol. 17 (1), 142. doi: 10.1186/s12870-017-1078-3

タイトルに関連する用語 (4件)： Rhodiola ,  ゲノム ,  同定 ,  発現解析