文献

J-GLOBAL ID：202202253296617585   整理番号：22A1027782

ヒト組織および体液における低分子RNA発現の質問のための新しい組織アトラスおよびオンラインツール【JST・京大機械翻訳】

A Novel Tissue Atlas and Online Tool for the Interrogation of Small RNA Expression in Human Tissues and Biofluids

著者 (27件)： Alsop Eric (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Meechoovet Bessie (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Kitchen Robert (2Cardiovascular Research Center, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, United States) ,  Sweeney Thadryan (2Cardiovascular Research Center, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, United States) ,  Beach Thomas G. (3Banner Sun Health Research Institute, Sun City, AZ, United States) ,  Serrano Geidy E. (3Banner Sun Health Research Institute, Sun City, AZ, United States) ,  Hutchins Elizabeth (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Ghiran Ionita (4Department of Medicine, Beth Israel Deaconess Medical Center and Harvard Medical School, Boston, MA, United States) ,  Reiman Rebecca (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Syring Michael (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Hsieh Michael (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Courtright-Lim Amanda (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Valkov Nedyalka (2Cardiovascular Research Center, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, United States) ,  Whitsett Timothy G. (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Rakela Jorge (5Mayo Clinic, Scottsdale, AZ, United States) ,  Pockros Paul (6Division of Gastroenterology/Hepatology, Scripps Clinic, La Jolla, CA, United States) ,  Rozowsky Joel (7Department of Molecular Biophysics and Biochemistry, Yale University, New Haven, CT, United States) ,  Gallego Juan (8Institute for Behavioral Science, The Feinstein Institute for Medical Research, Manhasset, NY, United States) ,  Gallego Juan (9Division of Psychiatry Research, The Zucker Hillside Hospital, Glen Oaks, NY, United States) ,  Gallego Juan (10Department of Psychiatry, Zucker School of Medicine at Hofstra/Northwell, Hempstead, NY, United States) ,  Huentelman Matthew J. (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States) ,  Shah Ravi (2Cardiovascular Research Center, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, United States) ,  Nakaji Peter (11Department of Neurosurgery, Banner Health, Phoenix, AZ, United States) ,  Kalani M. Yashar S. (12Department of Neurosurgery, St. John Medical Center, Tulsa, OK, United States) ,  Laurent Louise (13Department of Obstetrics, Gynecology, and Reproductive Sciences, University of California, San Diego, San Diego, CA, United States) ,  Das Saumya (2Cardiovascular Research Center, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, United States) ,  Van Keuren-Jensen Kendall (1Neurogenomics Division, The Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, United States)
資料名： Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web)  (Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web))
巻： 10  ページ： 804164  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7062A  ISSN： 2296-634X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 体液中で循環する分子情報を利用するための有望な目標は,臨床的に有用なバイオマーカーの発見である。細胞外RNA(exRNA)は分子カーゴの最も多様なクラスの一つであり,配列決定により容易にアッセイされ,被験者状態に応じて急速に変化する発現を伴う。多様なexRNAカーゴにもかかわらず,生体液からのほとんどの評価は,特にマイクロRNA(miRNA)に関して,小RNA配列決定と分析に焦点を合わせている。循環分子情報を特徴づける別の目標は,起源の特定組織に関連した損傷と発現の相関である。バイオマーカー候補は,特定の組織を豊富に,または疾患過程と関連するものとして,しばしば記述されている。同様に,miRNAデータは,クレームを支持する厳密な試験なしで,組織を豊富に含む特異的であることが報告されている。ここでは,30の異なる組織と3つの異なる血液細胞型から小RNAの組織アトラスを提供する。小さなRNA配列の濃縮のための組織を分析し,生体液中のそれらの発現を評価した:血漿,脳脊髄液,尿,および唾液。生理学的(休止対急性運動)と病的状態(早期対後期肝線維症,および脳卒中の異なるサブタイプ)を表す公表データセットを用いて,異なる組織強化小RNAを測定した。また,異なる生体液と組織に見られるexRNA配列に関する情報を提供するオンラインツールを開発した。このデータは,生物流体へのそれらの潜在的放出だけでなく,異なる組織での多様なタイプの小RNA配列をより良く理解するために使用でき,バイオマーカー研究の検証または設計に役立つ。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 血漿 ,  *RNA【核酸】 ,  血球 ,  髄液 ,  *体液 ,  尿 ,  ヒト ,  貨物 ,  脳卒中 ,  肝線維症 ,  アンチセンスRNA ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *アトラス ,  被験者 ,  *オンライン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 小RNA ,  プラズマ ,  尿 ,  唾液 ,  脳脊髄液 ,  細胞外小胞 ,  組織アトラス ,  細胞外RNA

分類 (4件)： 腫ようの診断  (GE03020J) ,  血液検査  (GC02050D) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (92件)：

• AbdelhamidR. F., PlessyC., YamauchiY., TaokaM., de HoonM., GingerasT. R., et al (2014). Multiplicity of 5′ Cap Structures Present on Short RNAs. PLoS One 9 (7), e102895. doi: 10.1371/journal.pone.0102895
• AgarwalV., BellG. W., NamJ.-W., BartelD. P. (2015). Predicting Effective microRNA Target Sites in Mammalian mRNAs. Elife 4. doi: 10.7554/eLife.05005
• AkatK. M., LeeY. A., HurleyA., MorozovP., MaxK. E. A., BrownM., et al (2019). Detection of Circulating Extracellular mRNAs by Modified Small-RNA-Sequencing Analysis. JCI Insight 4. doi: 10.1172/jci.insight.127317
• ArroyoJ. D., ChevilletJ. R., KrohE. M., RufI. K., PritchardC. C., GibsonD. F., et al (2011). Argonaute2 Complexes Carry a Population of Circulating microRNAs Independent of Vesicles in Human Plasma. Proc. Natl. Acad. Sci. 108 (12), 5003-5008. doi: 10.1073/pnas.1019055108
• Avendaño-VázquezS. E., Flores-JassoC. F. (2020). Stumbling on Elusive Cargo: How isomiRs challenge microRNA Detection and Quantification, the Case of Extracellular Vesicles. J. Extracellular Vesicles 9 (1), 1784617. doi: 10.1080/20013078.2020.1784617

タイトルに関連する用語 (9件)： ヒト ,  組織 ,  体液 ,  低分子RNA ,  発現 ,  質問 ,  アトラス ,  オンライン ,  ツール