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J-GLOBAL ID：202202253369629835   整理番号：22A0491555

DNAと蛋白質のアロメトリックスケーリング関係における情報理論的アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Information-theoretic approach in allometric scaling relations of DNA and proteins

著者 (1件)： Adiguzel Yekbun (Department of Medical Biology, School of Medicine, Atilim University, Ankara, Turkey)
資料名： Chemical Biology & Drug Design  (Chemical Biology & Drug Design)
巻： 99  号： 2  ページ： 331-343  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1436A  ISSN： 1747-0277  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アロメトリースケーリング関係は,分子パラメータの間で観察できる。したがって,蛋白質および遺伝子のサイズ(すなわち長さ)間のこのような関係の存在を検討した。アミノ酸数として文献中に蛋白質長が存在する。それらはまたmRNA長から誘導される。ここでは,そのようなデータを用いることにより,アロメトリースケーリング関係を調べ,同時に,データを,著者らの修正情報理論的アプローチから得られた遺伝子および蛋白質のサイズと比較した。結果は,計算結果におけるスケーリング関係の存在を示唆した。これは,情報理論的計算における実装された修正により期待された。文献ベースのデータにおける関係は,適合値の高い良さを欠いている。それは物理的因子および選択的圧力によるものであり,それはモデル中の文献ソース値の偏差に終わった。ゲノムサイズは細胞サイズと相関する。DNAサイズに関連する細胞内容積は,ある数の蛋白質を必要とし,そのサイズは蛋白質サイズと相関できる。細胞サイズ,ゲノムサイズ,および平均蛋白質および遺伝子サイズは,蛋白質数,すなわち遺伝子の発現レベルとともに,物理的因子であり,分子因子はそれらの物理的因子に影響を及ぼす。それらに対する選択圧力は,それらの物理的因子間の接続を通して作用し,ダイナミックレンジを制限する。生物学的対策は,そのような力を受けやすく,また,仮定の妥当性にかかわらず,予測モデルから逸脱する可能性があり,また,それらがモデルにも実装されない。しかし,現在の不一致は,モデル改善,データ不完全性,無効な仮定などの必要性を示すことができた。それでも,現在の研究は,アロメトリースケーリング関係研究における情報理論的アプローチの使用の可能性を強調する。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *情報理論 ,  アミノ酸 ,  *DNA【核酸】 ,  mRNA ,  遺伝子 ,  *タンパク質 ,  アロメトリー ,  ダイナミックレンジ ,  分子定数 ,  予測モデル
準シソーラス用語： 細胞サイズ ,  ゲノムサイズ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： アロメトリー ,  DNA ,  遺伝子サイズ ,  情報 ,  イントロン ,  蛋白質長 ,  Shannonエントロピー

分類 (1件)： 液-液界面  (CB12030F)

タイトルに関連する用語 (3件)： DNA ,  蛋白質 ,  情報理論