文献

J-GLOBAL ID：202202253474184269   整理番号：22A1091944

His23とLys79対はハロ酸デハロゲナーゼスーパーファミリーの無機ピロホスファターゼの高触媒効率を決定する【JST・京大機械翻訳】

The His23 and Lys79 pair determines the high catalytic efficiency of the inorganic pyrophosphatase of the haloacid dehalogenase superfamily

著者 (4件)： Zhang Mingming (Key Laboratory of Theoretical and Computational Photochemistry, Ministry of Education, College of Chemistry, Beijing Normal University, Beijing 100875, PR China) ,  Yang Ling (Wenzhou Institute, University of Chinese Academy of Sciences, Wenzhou 325001, PR China) ,  Ding Wanjian (Key Laboratory of Theoretical and Computational Photochemistry, Ministry of Education, College of Chemistry, Beijing Normal University, Beijing 100875, PR China) ,  Zhang Hao (Biomedical Research Center, College of Life Science and Engineering, Northwest Minzu University, Lanzhou, 730030, PR China)
資料名： Biochimica et Biophysica Acta  (Biochimica et Biophysica Acta)
巻： 1866  号： 6  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： B0207A  ISSN： 0005-2728  CODEN： BBBMBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ハロ酸デハロゲナーゼ(HAD)スーパーファミリーメンバーは主にホスホモノエステラーゼであるが,HADスーパーファミリーのBacteroides thetaiotaomicron由来のBT2127は無機ピロホスファターゼとして同定された。本研究では,BT2127によって触媒された無機ピロリン酸塩(PP_i)の加水分解反応におけるLys79とHis23対の役割を調査するために,一連のモデルを設計した。分散エネルギーD3-B3LYPによる密度汎関数理論(DFT)法を用いて計算を行った。His23とLys79対は,PPiによるBT2127の高い触媒効率において鍵となる役割を果たす。第1に,His23とLys79対は,Asp13を脱離基へ容易に提供し,ホスホ移動段階のエネルギー障壁を著しく低下させる。次に,Lys79は,His23を介して最初の脱離リン酸基にプロトンを提供し,より電気的に安定化したリン酸塩(H_3PO_4)を生成し,この段階を発熱させ,その後のホスホ-酵素中間体加水分解を促進する。結果は,Lys79-His23対がBT2127が酸触媒の強化によって高い触媒効率に達するのを助けることを示唆する。本研究は,HADスーパーファミリーのホスホモノエステラーゼと生体模倣酵素設計からのBT2127の無機ピロホスファターゼ機能の進化への詳細な化学的洞察を提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 脱着 ,  陽子 ,  酵素 ,  加水分解 ,  リン酸塩 ,  ピロリン酸塩 ,  *リン酸モノエステラーゼ ,  密度汎関数法 ,  中間体
準シソーラス用語： B3LYP法 ,  生体模倣 ,  *触媒効率 ,  酸触媒 ,  エネルギー障壁 ,  リン酸基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： BT2127 ,  触媒機構 ,  加水分解反応 ,  機能的分岐 ,  進化

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (4件)： ハロ ,  酸 ,  無機ピロホスファターゼ ,  触媒効率