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J-GLOBAL ID：202202253876022495   整理番号：22A1175993

経験的表現型-環境適合景観における環境選択とエピスタシス【JST・京大機械翻訳】

Environmental selection and epistasis in an empirical phenotype-environment-fitness landscape

著者 (4件)： Chen J. Z. (Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver, British Columbia, Canada) ,  Fowler D. M. (Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle, WA, USA) ,  Fowler D. M. (Department of Bioengineering, University of Washington, Seattle, WA, USA) ,  Tokuriki N. (Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver, British Columbia, Canada)
資料名： Nature Ecology & Evolution  (Nature Ecology & Evolution)
巻： 6  号： 4  ページ： 427-438  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4775A  ISSN： 2397-334X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 適応性に対する遺伝子型/表現型のマッピングは,進化生化学における貴重な概念である。広く議論されているが,蛋白質における表現型適合景観の測定は,乏しいままである。ここでは,アンピシリン濃度の64倍の範囲のVIM-2β-ラクタマーゼの適応性と表現型(EC_50)に対する全ての単一変異効果を定量化した。次に,環境選択圧力の変動を考慮した表現型適合景観を構築した。単純,経験的景観は,ΔΨ39,000変異データ点を正確にモデル化して,VIM-2の進化が選択環境に基づいて予測可能であることを示唆した。この景観は,一般的にβ-ラクタマーゼと蛋白質の進化,特にサブ阻害抗生物質濃度下のそれらの進化動力学,および非特異的エピスタシスの機構と環境依存性に関する新しい定量的知識を提供する。異なるアンピシリン濃度と各変異体の抗生物質耐性を有する環境にわたってVIM-2β-ラクタマーゼにおける単一点突然変異体を運ぶ大腸菌の適応度から適応度景観を構築し,β-ラクタマーゼの進化が環境における選択圧に基づいて予測できることを示した。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature Limited 2022 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 予測 ,  選択 ,  大腸菌 ,  遺伝子型 ,  抗生物質 ,  タンパク質 ,  突然変異体 ,  *表現型 ,  変異 ,  環境 ,  β-ラクタマーゼ ,  アミノ酸 ,  芳香族化合物 ,  ラクタム ,  硫黄複素環化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： *上位性 ,  適応度 ,  選択圧 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

物質索引 (1件)： アンピシリン

タイトルに関連する用語 (5件)： 経験 ,  表現型 ,  環境 ,  景観 ,  エピスタシス