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J-GLOBAL ID：202202253971612579   整理番号：22A0473893

redclawザリガニ(Cherax quadricarinatus)の親子帰属のためのマルチプレックスPCRアッセイの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of a multiplex PCR assay for parentage assignment of the redclaw crayfish (Cherax quadricarinatus)

著者 (12件)： Bian Yuling (Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources, Ministry of Agriculture, Shanghai Engineering Research Center of Aquaculture, National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education, College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai, Chi...) ,  Bian Yuling (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China) ,  Liu Shili (Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources, Ministry of Agriculture, Shanghai Engineering Research Center of Aquaculture, National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education, College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai, Chi...) ,  Liu Shili (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China) ,  Liu Yinuo (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China) ,  Jia Yongyi (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China) ,  Li Fei (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China) ,  Chi Meili (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China) ,  Zheng Jianbo (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China) ,  Cheng Shun (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China) ,  Gu Zhimin (Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources, Ministry of Agriculture, Shanghai Engineering Research Center of Aquaculture, National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education, College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai, Chi...) ,  Gu Zhimin (Key Laboratory of Genetics and Breeding, Zhejiang Institute of Freshwater Fisheries, Huzhou, China)
資料名： Aquaculture  (Aquaculture)
巻： 550  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0784A  ISSN： 0044-8486  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 赤則ザリガニとして一般的に知られているCherax quadrcarinatusは,巨大な商業的利点を有する。C.quadricarinatus集団の生殖質分解を防ぐために,その遺伝資源を保護する緊急の必要性がある。改良品種の育種における重要なリンクの一つは,ファミリー選択である。本研究では,C.quadricarinatusの全ゲノム配列に基づくマイクロサテライトマーカーをスクリーニングした。得られた多型テトラヌクレオチドマイクロサテライト遺伝子マーカーをキャピラリー電気泳動と組合せて,C.quadricarinatusの親子帰属に適した実験系を確立した。安定な増幅を有する60の多型四量体マイクロサテライトマーカーを,C.quadricarinatusの参照ゲノム配列からスクリーニングした。アニーリング温度,プライマー濃度,および組合せのサイクル数を連続的に最適化することによって,良好な増幅効果と高い多型情報量(PIC)を有する20のテトラヌクレオチドマイクロサテライト遺伝子座を得た。次に,多重PCRシステムをマイクロサテライトの5群を用いて構築した。CERVUS3.0ソフトウェアを用いて,既知の血統情報を有するC.quadricarinatusの12科における親子割り当てを行った。結果は,112の対立遺伝子が20の遺伝子座から増幅されたことを示した。観察されたヘテロ接合性(Ho)は0.458~0.917の範囲であった。予想されるヘテロ接合性(He)は0.435から0.832の範囲であり,PICは0.375から0.788の範囲であった。マイクロサテライトマーカーの大部分は高度に多型であり,親子割り当ての要求を満たすことができた。4つの組合せを用いて,実際の成功した割り当て率は97.20%から99.30%の範囲であり,そして,すべての5つの組合せを使用するとき,割り当て率は100%に達した。したがって,これらの集合を選択することは,正確な血統情報を得るだけでなく,作業負荷とコストも低減する。本研究で構築したマイクロサテライトマルチプレックスPCRシステムは,C.quadricarinatusの分子血統構築,個体群育種,および家族管理のための便利で有用な方法を提供し,このように,この重要な淡水甲殻類の正常な発達を確実にするための基礎を形成する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  多重化 ,  育種 ,  品種 ,  ソフトウェア ,  対立遺伝子 ,  *ザリガニ類 ,  個体群 ,  遺伝資源 ,  キャピラリー電気泳動 ,  マイクロサテライト
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  系統関係 ,  ゲノム配列 ,  マイクロサテライトマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Cherax quadricarinatus ,  四量体マイクロサテライトマーカー ,  多重PCR ,  親子割当

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： ザリガニ ,  Cherax ,  親子 ,  マルチプレックスPCR ,  アッセイ ,  開発