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J-GLOBAL ID：202202254087045230   整理番号：22A0990955

極端な中和表現型HIVエンベロープ蛋白質gp120の高温分子動力学シミュレーション研究【JST・京大機械翻訳】

High temperature molecular dynamics simulation study on the envelope protein gp120 of HIV strains with extreme neutralization phenotype

著者 (6件)： Li Yi (大理大学 数学与計算机学院,大理671003) ,  Li Shuang (大理大学 数学与計算机学院,大理671003) ,  Zhang Xiaoling (大理大学 数学与計算机学院,大理671003) ,  Ceng Xin (大理大学 数学与計算机学院,大理671003) ,  Sang Peng (大理大学 農学与生物科学学院,大理671003) ,  Yang Liquan (大理大学 農学与生物科学学院,大理671003)
資料名： Yuanzi yu Fenzi Wuli Xuebao  (Yuanzi yu Fenzi Wuli Xuebao)
巻： 39  号： 1  ページ： 95-102  発行年： 2022年 
JST資料番号： C2079A  ISSN： 1000-0364  CODEN： YYFXEM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： HIV感染細胞の蛋白質機械として、エンベロープタンパク質gp120は配列変異と構造柔軟性などの策略を利用して宿主免疫識別を逃避し、ウイルスが異なる中和表現型を呈する主な原因である。HIVの中和表現型の分子機構は初歩的に探求されているが、その熱力学に関する分子基礎はさらに解明する必要がある。本研究では、ホモロジーモデリングの方法を利用して、極限中和表現型HIV株(中和耐性株H061.14と中和感受性株R2)のgp120構造モデルを構築し、次第に上昇する温度勾配下で、高温分子動力学シミュレーションを行い、両者の構造安定性を研究した。折り畳みと立体配座の柔軟性の違いを解明した。その結果、HIV中和表現型はgp120の熱力学的性質と正の相関があり、アンフォールディング程度とは必然的に関連しないことが分かった。各温度におけるgp120の構造偏差、天然接触含有量、コンフォメーションポピュレーション分布、及び単一残基の柔軟性の比較は、中和感比中和抵抗gp120がより大きな構造偏差、より多くの立体配座状態及びより高い配座柔軟性を示すが、両者は類似なアンフォールディング程度を有することが明らかになった。極端な中和表現型HIVエンベロープタンパク質gp120の著しく異なる熱力学的性質から、HIVはgp120の熱力学的性質を利用して、そのコンフォメーションを調節し、さらにウイルス感染と免疫回避の間の矛盾をバランスさせることができると推測できる。我々の研究は、極端な中和表現型HIVエンベロープタンパク質gp120の立体配座柔軟性と構造安定性における差異を明らかにするだけでなく、高温解折り畳みの熱力学の角度から、極端な中和表現型HIVの背後の分子基礎を明確にした。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *高温 ,  熱力学 ,  熱力学的性質 ,  *分子 ,  立体配座 ,  *計算機シミュレーション ,  ウイルス感染 ,  *タンパク質 ,  *表現型 ,  デコンボリューション ,  折畳み ,  *HIV【ウイルス】 ,  *中性化
準シソーラス用語： 分子機構 ,  *分子動力学シミュレーション ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子の電子構造  (BH05010Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 中和 ,  表現型 ,  HIVエンベロープ蛋白質gp120 ,  分子動力学シミュレーション ,  研究