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J-GLOBAL ID：202202254231718622   整理番号：22A1058233

RNA環状化とマイクロRNAスポンジ形成の新しい分子機構【JST・京大機械翻訳】

A new molecular mechanism of RNA circularization and the microRNA sponge formation

著者 (10件)： Belter Agnieszka (Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Poznan, Poland) ,  Popenda Mariusz (Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Poznan, Poland) ,  Sajek Marcin (Institute of Human Genetics, Polish Academy of Sciences, Poznan, Poland) ,  Wozniak Tomasz (Institute of Human Genetics, Polish Academy of Sciences, Poznan, Poland) ,  Naskret-Barciszewska Miroslawa Z. (Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Poznan, Poland) ,  Szachniuk Marta (Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Poznan, Poland) ,  Szachniuk Marta (Institute of Computing Science, Poznan University of Technology, Piotrowo, Poznan, Poland;) ,  Jurga Stefan (NanoBioMedical Centre, Adam Mickiewicz University, Poznan, Poland) ,  Barciszewski Jan (Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Poznan, Poland) ,  Barciszewski Jan (NanoBioMedical Centre, Adam Mickiewicz University, Poznan, Poland)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 7  ページ： 3038-3045  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： miRNAの特異的結合により駆動されるRNA環状化の新しい機構について述べた。71のCUUCCペンタヌクレオチドモチーフは,それらの種子配列GGAAGを介して71のmiRNAに結合するRNAの全体の分子を通して規則的に分布するCUUCCペンタヌクレオチドモチーフを同定した。miR-7 RNAの逐次結合(71分子)は,CDR1の末端をRNA(1分子)として一緒にし,それぞれ5′と3′末端でヌクレオチドC_1とA_1299の間のホスホジエステル結合形成を刺激する。CDR1as RNAへのmiRNAの結合はユニークな複合体形成をもたらし,3つの特異的構造ドメインを示した。(i)内部ループを持つ2つの短いヘリックス,(ii)ヒンジ,および(iii)三重螺旋。提案した機構は,miRNAスポンジとして特異的RNA循環とその機能を説明する。さらに,CDR1とmiR-7との相互作用に関する既存の湿式実験データは,著者らの観察を完全に支持した。miR-671はmiR-7と同じ種子配列を示すが,CDR1aとのほとんど完全な二重螺旋を形成し,CDR1aの切断を誘導するが,環状化を刺激しない。共通が円形RNA間の提案された機構であるかどうかをチェックするために,著者らは,ほぼ1.1百万のシーケンスを計数する最も最近のサーキットデータベースを分析した。巨大な数の循環RNAが存在し,miRNAシード結合配列が全サーコRNA配列を通して分布し,線形転写物の環状化がmiRNA依存性であることを証明した。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 化学結合 ,  相互作用 ,  データベース ,  ヒンジ ,  *RNA【核酸】 ,  ヌクレオチド ,  ヒト ,  二重螺旋 ,  複合体 ,  *環化反応 ,  三重螺旋 ,  *アンチセンスRNA
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  ドメイン構造 ,  *分子機構 ,  ホスホジエステル結合 ,  miR-7 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： CDR1asRNA ,  miR-7 ,  miR-671 ,  ヒトmiRNA ,  環状RNA ,  円化

分類 (5件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (5件)： RNA ,  環状化 ,  マイクロRNA ,  スポンジ ,  分子機構