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J-GLOBAL ID：202202254488338227   整理番号：22A1179488

スケーラブル単一細胞プロテオミクスのためのキャピラリー電気泳動質量分析【JST・京大機械翻訳】

Capillary Electrophoresis Mass Spectrometry for Scalable Single-Cell Proteomics

著者 (9件)： Shen Bowen (1Department of Chemistry and Biochemistry, University of Maryland, College Park, MD, United States) ,  Pade Leena R. (1Department of Chemistry and Biochemistry, University of Maryland, College Park, MD, United States) ,  Choi Sam B. (1Department of Chemistry and Biochemistry, University of Maryland, College Park, MD, United States) ,  Munoz-LLancao Pablo (2Pharmacology and Physiology, School of Medicine and Health Sciences, The George Washington University, Washington, DC, United States) ,  Munoz-LLancao Pablo (3Department of Neuroscience and Cell Biology and Child Health Institute of New Jersey, Rutgers Robert Wood Johnson Medical School, The State University of New Jersey, New Brunswick, NJ, United States) ,  Munoz-LLancao Pablo (4Department of Cell Biology, Yale University School of Medicine, New Haven, CT, United States) ,  Manzini M. Chiara (2Pharmacology and Physiology, School of Medicine and Health Sciences, The George Washington University, Washington, DC, United States) ,  Manzini M. Chiara (3Department of Neuroscience and Cell Biology and Child Health Institute of New Jersey, Rutgers Robert Wood Johnson Medical School, The State University of New Jersey, New Brunswick, NJ, United States) ,  Nemes Peter (1Department of Chemistry and Biochemistry, University of Maryland, College Park, MD, United States)
資料名： Frontiers in Chemistry (Web)  (Frontiers in Chemistry (Web))
巻： 10  ページ： 863979  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7065A  ISSN： 2296-2646  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細胞の生化学の理解は,全ての分子の測定を必要とする。単細胞プロテオミクスは,マイクロ分析試料調製,ナノフロー液体クロマトグラフィー(ナノLC)による分離,キャピラリー電気泳動(CE),及びエレクトロスプレーイオン化(ESI)高分解能質量分析(HRMS)による検出の進歩により最近可能になった。ここでは,キャピラリーマイクロサンプリングCE-ESI-HRMSが,広い細胞次元にわたるプロテオミクスにスケーラブルであることを実証する。本研究は,マウス海馬の培養において,カエルXenopus laevisの胚から約250μm直径の細胞,および小型,~35μm直径のニューロンを用いた原理証明を確立した。全細胞プロテオームの18ngまたは~0.2%から,腹側動物正中線(V11)および赤道(V12)細胞の細胞内分析は,16細胞胚において1133の異なる蛋白質を同定した。CE-HRMSは,約20倍の感度を達成し,ナノLCと比較して機器測定の速度を二倍にし,選択の最も近い隣接単一細胞技術であった。ミクロ分析は,同定された左背側動物正中線細胞(D11)から,細胞蛋白質消化物の~5ngから722の蛋白質グループにスケーラブルであり,より小さな細胞に対する感度を支持した。キャピラリーマイクロサンプリングは培養から個々のニューロンの単離と移動を可能にし,3つの異なる細胞間の37の蛋白質を同定した。全部で224の蛋白質を,単一ニューロンに推定される500pgのニューロン蛋白質消化物から検出した。連続希釈は,試料量から157の蛋白質を,約半分の細胞(250pg蛋白質)と70のニューロン(125pg蛋白質)から推定し,細胞内プロテオミクスに対する十分な感度を示唆した。CE-ESI-HRMSは,広い細胞次元にわたるスケーラビリティ,感度,および速度を有するナノLCプロテオミクスを補完する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *質量分析 ,  ニューロン ,  希釈 ,  液体クロマトグラフィー ,  消化 ,  タンパク質 ,  マウス ,  海馬 ,  試料調製 ,  アフリカツメガエル ,  エレクトロスプレイイオン化 ,  *キャピラリー電気泳動 ,  *プロテオミクス ,  プロテオーム
準シソーラス用語： *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： キャピラリー電気泳動 ,  質量分析 ,  単一細胞 ,  アフリカツメガエル ,  マウス ,  プロテオミクス

分類 (5件)： 電気泳動分析  (CC04017K) ,  質量分析  (CC03013N) ,  有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

引用文献 (48件)：

• BaxiA. B., Lombard-BanekC., MoodyS. A., NemesP. (2018). Proteomic Characterization of the Neural Ectoderm Fated Cell Clones in the Xenopus laevis Embryo by High-Resolution Mass Spectrometry. ACS Chem. Neurosci. 9 (8), 2064-2073. doi: 10.1021/acschemneuro.7b00525
• ChenQ., YanG., GaoM., ZhangX. (2015). Ultrasensitive Proteome Profiling for 100 Living Cells by Direct Cell Injection, Online Digestion and Nano-LC-MS/MS Analysis. Anal. Chem. 87 (13), 6674-6680. doi: 10.1021/acs.analchem.5b00808
• ChoiS. B., Lombard-BanekC., Muñoz-LLancaoP., ManziniM. C., NemesP. (2018). Enhanced Peptide Detection toward Single-Neuron Proteomics by Reversed-phase Fractionation Capillary Electrophoresis Mass Spectrometry. J. Am. Soc. Mass. Spectrom. 29 (5), 913-922. doi: 10.1007/s13361-017-1838-1
• ChoiS. B., Muñoz-LLancaoP., ManziniM. C., NemesP. (2021). Data-Dependent Acquisition Ladder for Capillary Electrophoresis Mass Spectrometry-Based Ultrasensitive (Neuro)Proteomics. Anal. Chem. 93, 15964-15972. doi: 10.1021/acs.analchem.1c03327
• ChoiS. B., PolterA. M., NemesP. (2022). Patch-clamp Proteomics of Single Neurons in Tissue Using Electrophysiology and Subcellular Capillary Electrophoresis Mass Spectrometry. Anal. Chem.. doi: 10.1021/acs.analchem.1c03826

タイトルに関連する用語 (4件)： 単一細胞 ,  プロテオミクス ,  キャピラリー電気泳動 ,  質量分析