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J-GLOBAL ID：202202254575860023   整理番号：22A0479728

拘束ベースモデルとLC-MSメタボロミクスの統合による結腸直腸癌における腫瘍間質代謝クロストークの解明【JST・京大機械翻訳】

Elucidating tumor-stromal metabolic crosstalk in colorectal cancer through integration of constraint-based models and LC-MS metabolomics

著者 (11件)： Wang Junmin (Department of Biomedical Engineering, University of Southern California, Los Angeles, CA, 90089, USA) ,  Delfarah Alireza (Mork Family Department of Chemical Engineering and Materials Science, University of Southern California, Los Angeles, CA, 90089, USA) ,  Gelbach Patrick E. (Department of Biomedical Engineering, University of Southern California, Los Angeles, CA, 90089, USA) ,  Fong Emma (Lawrence J. Ellison Institute for Transformative Medicine, Los Angeles, CA, 90064, USA) ,  Macklin Paul (Department of Intelligent Systems Engineering, Indiana University, Bloomington, IN, 46202, USA) ,  Mumenthaler Shannon M. (Lawrence J. Ellison Institute for Transformative Medicine, Los Angeles, CA, 90064, USA) ,  Mumenthaler Shannon M. (Division of Medical Oncology, Norris Comprehensive Cancer Center, University of Southern California, Los Angeles, CA, 90033, USA) ,  Graham Nicholas A. (Mork Family Department of Chemical Engineering and Materials Science, University of Southern California, Los Angeles, CA, 90089, USA) ,  Finley Stacey D. (Department of Biomedical Engineering, University of Southern California, Los Angeles, CA, 90089, USA) ,  Finley Stacey D. (Mork Family Department of Chemical Engineering and Materials Science, University of Southern California, Los Angeles, CA, 90089, USA) ,  Finley Stacey D. (Department of Quantitative and Computational Biology, University of Southern California, Los Angeles, CA, 90089, USA)
資料名： Metabolic Engineering  (Metabolic Engineering)
巻： 69  ページ： 175-187  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1646A  ISSN： 1096-7176  CODEN： MEENFM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結腸直腸癌(CRC)は,米国における罹患率と死亡率の主な原因である。腫瘍微小環境における腫瘍-間質代謝クロストークは,CRC発生と進行を促進するが,間質細胞,特に癌関連線維芽細胞(CAFs)が腫瘍細胞の代謝にどのように影響するかは,不明のままである。ここでは,制約に基づくモデリングとメタボロームプロファイリングを統合した,CRC細胞とCAFの間の代謝相互作用を検討するためのデータ駆動アプローチを行った。メタボロミクスデータを用いて,CAF条件培地の有無で処理したCRC細胞における中心炭素代謝のフラックス分布を推論するために,非定常状態節約フラックスバランス解析を行った。著者らは,CAFsが解糖の刺激,ペントースリン酸経路(PPP)の酸化腕,およびグルタミリシス,ならびにトリカルボン酸サイクルの阻害を介してCRC代謝を再プログラムすることを発見した。潜在的治療標的を同定するために,酵素ノックアウトをシミュレートし,CAF処理CRC細胞が特にヘキソキナーゼおよびグルコース-6-リン酸の阻害,解糖および酸化的PPPの速度制限段階に感受性であることを見出した。この研究は,CRC細胞とCAFの間の代謝相互作用への機構的洞察を与え,CRC標的化治療に対する仮説試験のフレームワークを提供する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酸化 ,  リン酸 ,  解糖 ,  *間質組織 ,  *腫瘍 ,  腫瘍細胞 ,  ヘキソキナーゼ ,  仮説検定 ,  *LC-MS分析 ,  ターゲティング ,  *クロストーク
準シソーラス用語： *メタボロミクス ,  メタボローム ,  *結腸直腸癌 ,  治療標的 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 腫瘍微小環境 ,  メタボロミクス ,  数学的バイオサイエンス ,  システム生物学 ,  フラックスバランス解析

分類 (2件)： 代謝と栄養  (EG03054K) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (9件)： 拘束 ,  モデル ,  LC-MS ,  メタボロミクス ,  統合 ,  結腸直腸癌 ,  腫瘍間質 ,  代謝 ,  クロストーク