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J-GLOBAL ID：202202254811393303   整理番号：22A1038371

バイオインフォマティクスとqPCR検証に基づくミクロフィブリル関連蛋白質2(MFAP2)の汎癌分析【JST・京大機械翻訳】

Pan-Cancer Analysis of Microfibrillar-Associated Protein 2 (MFAP2) Based on Bioinformatics and qPCR Verification

著者 (6件)： Qiu Zhilei (Department of Urology, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, Shandong 266071, China) ,  Xin Miao (Department of Anesthesiology, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, Shandong 266071, China) ,  Wang Chenyang (Qingdao University, Qingdao, Shandong 266071, China) ,  Zhu Yueli (Department of Radiology, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, Shandong 266071, China) ,  Kong Qingnuan (Department of Pathology, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, Shandong 266071, China) ,  Liu Zhijun (Department of Urology, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao, Shandong 266071, China)
資料名： Journal of Oncology (Web)  (Journal of Oncology (Web))
巻： 2022  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7781A  ISSN： 1687-8450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： MFAP2は,いくつかのタイプのヒト癌において発癌性の役割を果たすことが報告されている。しかし,種々の癌におけるMFAP2の発現プロファイルとその予後と免疫浸潤への影響は不明なままである。本研究では,正常組織,腫瘍細胞株,および33の悪性腫瘍組織におけるMFAP2のmRNA発現と蛋白質発現を,遺伝子型-Tissue発現(GTEx),癌細胞株Encycledia(CCLE),および癌ゲノムAtlas(TCGA),OncominとUALCANデータベースを用いて包括的に分析し,癌の異なるグレードとステージにおけるMFAP2の発現を,遺伝子発現プロファイリング相互作用分析2(GEPIA2)と腫瘍および免疫システム相互作用データベース(TISIDB)を用いて評価した。一般的に,MFAP2は,多くの腫瘍と正常組織で異なる発現を示し,腫瘍グレードが高く,腫瘍ステージが高く,多発性癌で生存不良であった。UALCANデータベースとcBioPortalデータベースの探索は,mRNAレベル発現におけるこの差異が,ゲノムレベルでの異常なDNAメチル化と突然変異に部分的に起因することを明らかにした。加えて,MFAP2発現は,異なる癌型で腫瘍変異負荷,マイクロサテライト不安定性およびネオ抗原と関係した。さらに重要なことに,TIMERとTISIDBデータベースも,MFAP2レベルが免疫浸潤量と免疫関連遺伝子マーカー,ならびにESTIMATEスコアと有意に相関することを示した。qPCRにより,MFAP2発現を4種類の腫瘍組織試料において検証した。本研究は,いくつかのデータベースを組み合わせて,MFAP2の発現プロファイル,メチル化,および突然変異の汎癌分析,および予後と免疫浸潤に対するその含意について行い,MFAP2が多くの腫瘍の悪性特性に寄与することを示唆する。MFAP2は予後価値を有する重要なバイオマーカーであり,腫瘍免疫療法の標的である可能性がある。Copyright 2022 Zhilei Qiu et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *情報科学 ,  データベース ,  浸潤 ,  *生物学 ,  メチル化 ,  mRNA ,  腫瘍 ,  *タンパク質 ,  突然変異 ,  ヒト ,  ゲノム ,  予後 ,  バイオマーカー ,  *定量的PCR法
準シソーラス用語： 悪性腫瘍 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (36件)：

• M. Abbott, Y. Ustoyev, "Cancer and the immune system: the history and background of immunotherapy," Seminars in Oncology Nursing, vol. 35, no. 5, 2019.
• R. Grosser, L. Cherkassky, N. Chintala, P. S. Adusumilli, "Combination immunotherapy with CAR T cells and checkpoint blockade for the treatment of solid tumors," Cancer Cell, vol. 36, no. 5, pp. 471-482, 2019.
• C. E. Rudd, "A new perspective in cancer immunotherapy: PD-1 on myeloid cells takes center stage in orchestrating immune checkpoint blockade," Science Immunology, vol. 5, no. 43, pp. 5, 2020.
• C. Ralph, E. Elkord, D. J. Burt, J. F. O'Dwyer, E. B. Austin, P. L. Stern, R. E. Hawkins, F. C. Thistlethwaite, "Modulation of lymphocyte regulation for cancer therapy: a phase II trial of tremelimumab in advanced gastric and esophageal adenocarcinoma," Clinical Cancer Research, vol. 16, no. 5, pp. 1662-1672, 2010.
• M. J. Overman, R. McDermott, J. L. Leach, S. Lonardi, H.-J. Lenz, M. A. Morse, J. Desai, A. Hill, M. Axelson, R. A. Moss, M. V. Goldberg, Z. A. Cao, J.-M. Ledeine, G. A. Maglinte, S. Kopetz, T. André, "Nivolumab in patients with metastatic DNA mismatch repair-deficient or microsatellite instability-high colorectal cancer (CheckMate 142): an open-label, multicentre, phase 2 study," The Lancet Oncology, vol. 18, no. 9, pp. 1182-1191, 2017.

タイトルに関連する用語 (7件)： バイオインフォマティクス ,  qPCR ,  検証 ,  ミクロフィブリル ,  蛋白質 ,  癌 ,  分析