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J-GLOBAL ID：202202254956559352   整理番号：22A1058239

SARS-CoV-2主要プロテアーゼ(m→ηpro)に対するイサチン誘導体に基づく潜在的阻害剤の定量:分子ドッキング,分子動力学および構造活性相関研究【JST・京大機械翻訳】

Determination of potential inhibitors based on isatin derivatives against SARS-CoV-2 main protease (m^pro): a molecular docking, molecular dynamics and structure-activity relationship studies

著者 (8件)： Badavath Vishnu Nayak (Institute for Drug Research, The Hebrew University, Jerusalem, Israel) ,  Kumar Akhil (Biotechnology Division, CSIR-Central Institute of Medicinal and Aromatic Plants, Lucknow, India) ,  Samanta Pralok K. (School of Chemical and Bioprocess Engineering, University College Dublin, Dublin, Ireland) ,  Maji Siddhartha (Department of Pharmaceutical Sciences and Technology, Birla Institute of Technology, Mesra, Ranchi, India) ,  Das Anik (Department of Chemistry, Institute of Science, GITAM (Deemed to be University), Visakhapatnam, India) ,  Blum Galia (Institute for Drug Research, The Hebrew University, Jerusalem, Israel) ,  Jha Anjali (Department of Chemistry, Institute of Science, GITAM (Deemed to be University), Visakhapatnam, India) ,  Sen Anik (Department of Chemistry, Institute of Science, GITAM (Deemed to be University), Visakhapatnam, India)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 7  ページ： 3110-3128  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： SARS-COV-2,新規コロナウイルスおよび世界的大流行COVID-19の根は,世界中で重度の健康脅威を引き起こした。特異的処理の欠如は,ウイルス蛋白質の潜在的阻害剤を見つける努力を提起した。SARS-CoV-2主要プロテアーゼ(Mpro)の最近発明された結晶構造とそのウイルス複製における重要な役割;どのヒトプロテアーゼに対する非レムランスは,阻害剤研究に対する完全な標的になる。本論文は,5つの天然物および7つの目的薬物と比較して,16の異なる複素環部位を有する118化合物のスクリーニングのためのコンピュータ支援薬物設計(CADD)アプローチを報告する。Mpro蛋白質に対する分子ドッキング分析は,オキシジアゾール(A2およびA4)誘導体とリンクしたイサチンの発見を行い,それぞれ-11.22kcal/molおよび-11.15kcal/molの最良のドッキングスコアを示した。構造活性相関研究は,既知の活性Mpro阻害剤と,-0.67μMのIC_50値を有する再目的薬物エブセレンとの良好な比較を示した。50nsの分子動力学(MD)シミュレーションをA2およびA4に対して行い,結合ポケット内の2つの化合物の安定性を支持し,主にS1,S2およびS4ドメインで,高い結合エネルギーを有するS1,S2およびS4ドメインで,SARS-CoV-2に対するMproの潜在的阻害剤としての適合性を示唆した。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶構造 ,  シミュレーション ,  ターゲット ,  *ドッキング ,  ヒト ,  ウイルスタンパク質 ,  結合部位 ,  *ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  ウイルス複製 ,  複素環化合物 ,  *コロナウイルス科 ,  *分子動力学 ,  *分子認識 ,  ケトン ,  ラクタム ,  芳香族縮合化合物
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  *重症急性呼吸器症候群 ,  *分子ドッキング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： SARS-CoV-2 ,  複素環阻害剤 ,  密度汎関数理論 ,  分子ドッキング ,  分子動力学

分類 (2件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  抗ウイルス薬の基礎研究  (GW17040O)

物質索引 (1件)： イサチン

タイトルに関連する用語 (10件)： SARS-CoV-2 ,  プロテアーゼ ,  PRO ,  イサチン誘導体 ,  阻害剤 ,  定量 ,  分子ドッキング ,  分子動力学 ,  構造活性相関 ,  研究