文献

J-GLOBAL ID：202202257214903022   整理番号：22A0685381

ABC蛋白質スーパーファミリーの系統的解析および比較は4つのワタ種への構造的,機能的および進化的洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Systematic analysis and comparison of ABC proteins superfamily confer structural, functional and evolutionary insights into four cotton species

著者 (9件)： Afzal Malik Waqar (State Key Laboratory of Cotton Biology / Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences / Zhengzhou Research Base, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University Research Base, Zhengzhou University / Key Laboratory for Cotton Genetic Improvement, MOA, Anya...) ,  Afzal Maria (Department of Agronomy, Pir Mehr Ali Shah, Arid Agriculture University, Rawalpindi, Punjab, Pakistan) ,  Chen Xiugui (State Key Laboratory of Cotton Biology / Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences / Zhengzhou Research Base, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University Research Base, Zhengzhou University / Key Laboratory for Cotton Genetic Improvement, MOA, Anya...) ,  Cui Ruifeng (State Key Laboratory of Cotton Biology / Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences / Zhengzhou Research Base, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University Research Base, Zhengzhou University / Key Laboratory for Cotton Genetic Improvement, MOA, Anya...) ,  Lu Xuke (State Key Laboratory of Cotton Biology / Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences / Zhengzhou Research Base, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University Research Base, Zhengzhou University / Key Laboratory for Cotton Genetic Improvement, MOA, Anya...) ,  Wang Shuai (State Key Laboratory of Cotton Biology / Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences / Zhengzhou Research Base, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University Research Base, Zhengzhou University / Key Laboratory for Cotton Genetic Improvement, MOA, Anya...) ,  Wang Jing (State Key Laboratory of Cotton Biology / Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences / Zhengzhou Research Base, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University Research Base, Zhengzhou University / Key Laboratory for Cotton Genetic Improvement, MOA, Anya...) ,  Mahmood Imran (Department of Agronomy, Pir Mehr Ali Shah, Arid Agriculture University, Rawalpindi, Punjab, Pakistan) ,  Ye Wuwei (State Key Laboratory of Cotton Biology / Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences / Zhengzhou Research Base, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University Research Base, Zhengzhou University / Key Laboratory for Cotton Genetic Improvement, MOA, Anya...)
資料名： Industrial Crops and Products  (Industrial Crops and Products)
巻： 177  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W0732A  ISSN： 0926-6690  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ATP結合カセット輸送体(ABCT)は,生命の全てのドメインで普遍的に見出され,濃度勾配を横断するリガンドのATP依存性活性輸送に関与する,内在性膜蛋白質から成る最大の遺伝子スーパーファミリーの一つである。ここでは,7つの植物種から4つの群(Full,半分,QuarterおよびABC2分子),8つのファミリー(ABCAからABCGおよびABCI),および12の亜科(MDR,PDR,MRP,PMP,AOH,ATH,ATM,TAP,WBC,RLI,GCNおよびNAP)へのABC蛋白質の同定および分布を,4つのワタ種,特に320のORFをコードする4つのワタ種,特に四倍体Gossypium hirsutum(Gh)に基づいて示した。各亜科からの構造的に特性化されたABCTsの複合体形成の動力学は,ATP加水分解と基質転座の結合を結合させるそれらの速度論と分子機構を示し,”機能関係への構造”を描写する。蛋白質モチーフとゲノム組織の解析は,同じサブファミリー内で構造的および機能的保存を示したが,異なるサブファミリー間で分岐した。小型単一ABCの豊度は,機能的進歩と環境適応性に対するより高い遺伝子死/出生率と進行中の進化を意味する。遺伝子重複関係分析は,上述の種におけるABC遺伝子ファミリーの大規模拡大におけるタンデムおよび分節重複の主要な役割を示す。全体的なKa/Ks比は,進化の間の4つのワタ種におけるABC遺伝子の強い精製選択を示した。さらに,GhABCの組織特異的発現プロファイリング,非生物的ストレス耐性およびCo発現ネットワーク化は,多様な分子,細胞,および生物学的過程におけるそれらの役割を推論する。シスエレメントと遺伝子濃縮も,基質転座,生体異物脱毒素,脂質代謝,ホルモンおよび非生物的ストレス応答におけるそれらの予測役割を支持した。進化軌跡,構造動力学および検証発現プロファイリングとともに,前方および逆遺伝学は,将来の研究のために,非常に必要な透明性および定性的な分子フレームワークを提供するであろう。本研究は,ワタにおけるABC遺伝子ファミリーの進化と機能的解明への我々の洞察をさらに広げるであろう。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  基質 ,  死 ,  毒素 ,  ヌクレオチド配列 ,  ホルモン ,  複合体 ,  環境順応 ,  四倍体 ,  転座 ,  遺伝子重複 ,  ワタ属 ,  *ABC輸送体
準シソーラス用語： 分子機構 ,  シスエレメント ,  非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： TMD ,  NBD ,  分子配向 ,  膜蛋白質 ,  基質転座 ,  生体異物

分類 (3件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  作物の品種改良  (FC02030G) ,  繊維料作物  (FC03077U)

タイトルに関連する用語 (7件)： ABC蛋白質 ,  ファミリー ,  系統 ,  解析 ,  ワタ ,  進化 ,  洞察