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J-GLOBAL ID：202202257989657897   整理番号：22A0751869

N6-メチルアデノシン関連lncRNAプロファイリングに基づく肝細胞癌の分類【JST・京大機械翻訳】

Classification of Hepatocellular Carcinoma Based on N6-Methylandenosine-Related lncRNAs Profiling

著者 (7件)： Yin Lu (1Department of Pathology, Affiliated Hangzhou First People’s Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China) ,  Zhou Liuzhi (2Department of Surgery, The Second Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China) ,  Gao Shiqi (3Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China) ,  Feng Yina (4School of Statistics and Mathematics, Zhejiang Gongshang University, Hangzhou, China) ,  Zhu Hanzhang (5Department of Hepatobiliary and Pancreatic Surgery, Affiliated Hangzhou First People’s Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China) ,  Xiang Jingjing (1Department of Pathology, Affiliated Hangzhou First People’s Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China) ,  Xu Rujun (1Department of Pathology, Affiliated Hangzhou First People’s Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 807418  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HCCは,世界中で最も頻度の高い悪性腫瘍の1つであり,癌死亡の第4誘導原因である。したがって,HCCにおける新規標的治療を探索する緊急の必要性がある。186m6a関連lncRNAをその後の分析のためにスクリーニングした。2つの異なるm6A修飾クラスターは,m6A関連lncRNAsプロファイリングに基づくTCGA-LIHCにおける全体的予後と関連することが同定され,単変量Cox回帰分析が続いた。さらに,4つのm6A関連lncRNAs予後シグネチャを開発し,HCC患者のOSを予測でき,単変量Cox回帰,LASSO回帰,および多変量Cox回帰分析を行った。さらに,4つのm6A関連lncRNAがHCC予後に関連すると同定された。ESTIMATEを用いて,各HCC試料の間質スコア,免疫スコア,ESTIMATEスコア,および腫瘍純度を評価し,各サンプルにおける29の免疫シグネチャの濃縮レベルを同定するために,ssGSEAを実施した。最後に,定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応は,KDM4A-AS1,BACE1-ASおよびNRAV発現がHCC患者でアップレギュレートされることを示した。著者らは,m6A関連lncRNAシグネチャが,異なるHCCサブグループのOSを予測するための強力で堅牢な能力を持つことを証明した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  間質組織 ,  死 ,  腫瘍 ,  純度 ,  クラスタ ,  予後 ,  ロバスト性 ,  *肝細胞癌 ,  バイオマーカー ,  分子標的療法
準シソーラス用語： 悪性腫瘍 ,  定量的リアルタイムPCR法 ,  *非翻訳長鎖RNA ,  多変量 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 肝細胞癌 ,  m6A関連lncRNA ,  腫瘍微小環境 ,  分類 ,  予後 ,  バイオマーカー ,  機械学習

分類 (3件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

引用文献 (38件)：

• AbbastabarM., SarfiM., GolestaniA., KhaliliE. (2018). lncRNA Involvement in Hepatocellular Carcinoma Metastasis and Prognosis. Excli j 17, 900-913. doi: 10.17179/excli2018-1541
• BarbieD. A., TamayoP., BoehmJ. S., KimS. Y., MoodyS. E., DunnI. F., et al (2009). Systematic RNA Interference Reveals that Oncogenic KRAS-Driven Cancers Require TBK1. Nature 462 (7269), 108-112. doi: 10.1038/nature08460
• BatistaP. J. (2017). The RNA Modification N 6 -methyladenosine and its Implications in Human Disease. Genomics, Proteomics & Bioinformatics 15 (3), 154-163. doi: 10.1016/j.gpb.2017.03.002
• BerrettaJ., MorillonA. (2009). Pervasive Transcription Constitutes a New Level of Eukaryotic Genome Regulation. EMBO Rep. 10 (9), 973-982. doi: 10.1038/embor.2009.181
• ChenQ., LiuX., XuL., WangY., WangS., LiQ., et al (2016). Long Non-coding RNA BACE1-AS Is a Novel Target for Anisomycin-Mediated Suppression of Ovarian Cancer Stem Cell Proliferation and Invasion. Oncol. Rep. 35 (4), 1916-1924. doi: 10.3892/or.2016.4571

タイトルに関連する用語 (4件)： lncRNA ,  プロファイリング ,  肝細胞癌 ,  分類