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J-GLOBAL ID：202202258100369226   整理番号：22A0732511

多剤耐性非定型病原性大腸菌O177株の遺伝的多様性と全ゲノム配列解析データ:食品安全性と公衆衛生含意の評価【JST・京大機械翻訳】

Genetic diversity and whole genome sequence analysis data of multidrug resistant atypical enteropathogenic Escherichia coli O177 strains: An assessment of food safety and public health implications

著者 (7件)： Montso Peter Kotsoana (Food Security and Safety Niche Area, Faculty of Natural and Agricultural Sciences, North-West University - Mafikeng Campus, Private Bag X2046, Mmabatho 2735, South Africa) ,  Bezuidenhout Cornelius Carlos (Unit for Environmental Sciences and Management, North-West University, Potchefstroom, South Africa) ,  Mienie Charlotte (Unit for Environmental Sciences and Management, North-West University, Potchefstroom, South Africa) ,  Somorin Yinka M. (School of Pharmacy, Queen’s University Belfast, Belfast, United Kingdom) ,  Odeyemi Olumide A. (Office of Research Services, Research Division, University of Tasmania, Launceston, Australia) ,  Mlambo Victor (School of Agricultural Sciences, Faculty of Agriculture and Natural Sciences, University of Mpumalanga, Private Bag X11283, Mbombela 1200, South Africa) ,  Ateba Collins Njie (Food Security and Safety Niche Area, Faculty of Natural and Agricultural Sciences, North-West University - Mafikeng Campus, Private Bag X2046, Mmabatho 2735, South Africa)
資料名： International Journal of Food Microbiology  (International Journal of Food Microbiology)
巻： 365  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0434C  ISSN： 0168-1605  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非定型腸病原性大腸菌(aEPEC)株は世界中のヒトにおける致死下痢の原因となる病原体である。本研究の目的は,南アフリカの集約的で広範な生産システムで飼育されたウシの糞から分離したaEPEC O177株の遺伝的多様性,病原性および抗菌耐性プロファイルを調べることであった。合計96の多剤耐性(MDR)aEPEC O177分離株を,腸内細菌反復遺伝子間コンセンサス(ERIC)とランダム増幅多型DNA(RAPD)タイピングを用いてタイプ化した。2つのaEPEC O177分離株のレジストーム,virulomeおよびモビロームをWGS分析を用いて調べた。ERICタイピングは効率的で再現性があり,識別指数は0.95であった。RAPDタイピングは,0.859の満足な識別力で,低い再現性を示した。ERICおよびRAPDバンドパターンに基づいて構築した系統樹は,それぞれ9および8クラスターを生成し,大腸菌O177分離株間の遺伝的変異を示した。WGS分析は,CF-154-AおよびCF-335-B分離株が,それぞれH7およびH21を有するO177血清型に属することを明らかにした。両分離株は,intimin(eaeA),溶血素(hlyAおよびhlyE),転座鉄受容体(tir),III型分泌系(eprH,gspLおよびprgH),bssRおよびbssSのようないくつかのウイルス遺伝子を持っていた。しかし,シガ毒素をコードする遺伝子はいずれの分離株でも見られなかった。E.coli O177株において,ampC,tet,ermB,sul2,strB AcrD,aph(6)-Ic,aph(6)-Ib,aph(3′′)-I,アリ(3′′)-1a AcrAおよびacrEのような抗生物質耐性遺伝子を見出した。さらに,ゲノムアノテーションの結果は,両方の分離株がプラスミド,挿入配列,プロファージ,および規則的に間隔の短いパリンドローム反復(CRISPR)タイプIのクラスタを運ぶことを示した。in silicoマルチ遺伝子座タイピング(MLST)分析に基づいて,2つの分離株を異なる配列タイプ(CF-154-A,ST-1308およびCF-335-B,ST-58)に割り当てた。全ゲノムマルチ遺伝子座タイピング系統樹は,この分離株が大腸菌O177:H21(参照)とクラスターを形成し,菌株間の密接なゲノム関連性を示唆した。全体として,これらの知見から,ウシは遺伝的に多様なE.coli O177株を持ち,それはvirulome,レジストームおよびモビローム遺伝子のレパートリーを有することが示された。これは,ウシにおける多剤耐性大腸菌O177株サーベイランスの必要性を強調する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  *遺伝 ,  ウシ ,  *腸 ,  ヒト ,  糞便 ,  系統樹 ,  系統発生 ,  クラスタ ,  プラスミド ,  血清型 ,  *多剤耐性 ,  *病原性大腸菌 ,  RAPD法
準シソーラス用語： 分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 大腸菌O177 ,  全ゲノム配列決定 ,  病原性遺伝子 ,  抗生物質耐性遺伝子 ,  系統発生関係 ,  食品の安全性

分類 (2件)： 食品の汚染  (FJ01053P) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： 多剤耐性 ,  病原性大腸菌 ,  遺伝的多様性 ,  ゲノム配列 ,  解析データ ,  食品安全性 ,  公衆衛生 ,  含意 ,  評価