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J-GLOBAL ID：202202258345306321   整理番号：22A1024704

Gossypium hirsutum(ワタ) Gossypium barbadenseの種間戻し交雑近交系個体群における種子サイズおよび形状に影響する候補遺伝子の量的形質遺伝子座解析と同定【JST・京大機械翻訳】

Quantitative Trait Locus Analysis and Identification of Candidate Genes Affecting Seed Size and Shape in an Interspecific Backcross Inbred Line Population of Gossypium hirsutum × Gossypium barbadense

著者 (15件)： Wu Luyao (Zhengzhou Research Base, State Key Laboratory of Cotton Biology, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University, Zhengzhou, China) ,  Wu Luyao (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Jia Bing (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Pei Wenfeng (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Wang Li (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Ma Jianjiang (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Wu Man (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Song Jikun (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Yang Shuxian (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Xin Yue (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Huang Li (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Feng Pan (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China) ,  Zhang Jinfa (Department of Plant and Environmental Sciences, New Mexico State University, Las Cruces, NM, United States) ,  Yu Jiwen (Zhengzhou Research Base, State Key Laboratory of Cotton Biology, School of Agricultural Sciences, Zhengzhou University, Zhengzhou, China) ,  Yu Jiwen (State Key Laboratory of Cotton Biology, Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, China)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 13  ページ： 837984  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 種子サイズと形状はワタ(Gossypium spp.)の種子ワタ収量と種子品質に影響する重要な農業形質である。しかし,ワタの種子の物理的形質を調節する遺伝的メカニズムはほとんど知られていない。本研究では,反復親Upland CRI36(Gossypium hirsutum)とHai7124(Gossypium barbadense)由来の250BC_1F_7系統の種間戻し交配近交系(BIL)個体群を用いて,量的形質遺伝子座(QTL)マッピングと候補遺伝子同定によるワタ種子物理的形質の遺伝的基礎を調べた。BILsを5つの環境で試験して,8つの種子サイズと形状関連形質を測定し,100粒重,カーネル長幅,およびそれらの比率,カーネル面積,カーネル直径,およびカーネル真円度を測定した。7709の単一ヌクレオチド多型(SNP)マーカーに基づいて,合計49のQTLを検出し,それぞれ,少なくとも3つの環境でマッピングされた9つの安定QTLを含む表現型変異の2.91~35.01%を説明した。経路濃縮,遺伝子アノテーション,ゲノム配列,および発現分析に基づいて,澱粉シンターゼ4,転写因子PIF7およびMYC4,ユビキチン結合酵素E27,およびTHO複合体サブユニット4Aをコードする5つの遺伝子を,種子サイズと形状と関連する可能性がある候補遺伝子として同定した。本研究はワタ育種における種子の物理的形質を改善する貴重な情報を提供する。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *種子 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  育種 ,  *個体群 ,  *戻し交雑 ,  転写因子 ,  *ワタ属 ,  *量的形質遺伝子座 ,  アノテーション ,  一塩基多型
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  *候補遺伝子 ,  *近交系 ,  遺伝子同定 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Gossypium hirsutum ,  Gossypium barbadense ,  戻し交雑近交系 ,  種子の大きさと形状 ,  量的形質遺伝子座 ,  候補遺伝子

分類 (2件)： 繊維料作物  (FC03077U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (70件)：

• Atique-ur-Rehman, Kamran M., Afzal I. (2020). “"Production and processing of quality cotton seed,"” in Cotton Production and Uses, eds Ahmad S, Hasanuzzaman M. (Singapore: Springer). doi: 10.1007/978-981-15-1472-2_27
• Chen F., Guo Y., Chen L., Gan X., Xu W. (2020). Global identification of genes associated with xylan biosynthesis in cotton fiber. J. Cotton Res. 3:15. doi: 10.1186/s42397-020-00063-3
• Cingolani P., Platts A., Wang Le L., Coon M., Nguyen T., Wang L., et al (2012). A program for annotating and predicting the effects of single nucleotide polymorphisms, SnpEff: SNPs in the genome of Drosophila melanogaster strain w1118; iso-2; iso-3. Fly 6 80-92. doi: 10.4161/fly.19695
• Deng X., Gong J., Liu A., Shi Y., Gong W., Ge Q., et al (2019). QTL mapping for fiber quality and yield-related traits across multiple generations in segregating population of CCRI 70. J. Cotton Res. 2:13. doi: 10.1186/s42397-019-0029-y
• Do T. H. T., Martinoia E., Lee Y. (2018). Functions of ABC transporters in plant growth and development. Curr. Opin. Plant Biol. 41 32-38. doi: 10.1016/j.pbi.2017.08.003

タイトルに関連する用語 (9件)： Gossypium ,  ワタ ,  戻し交雑 ,  近交系 ,  個体群 ,  種子サイズ ,  候補遺伝子 ,  量的形質遺伝子座解析 ,  同定