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J-GLOBAL ID：202202259103430312   整理番号：22A1181196

C1Qのサブユニットは慢性四肢-血栓性虚血への間欠的 C行の進行と関連する【JST・京大機械翻訳】

Subunits of C1Q Are Associated With the Progression of Intermittent Claudication to Chronic Limb-Threatening Ischemia

著者 (7件)： Yao Ziping (Department of Interventional Radiology and Vascular Surgery, Peking University First Hospital, Beijing, China) ,  Zhang Bihui (Department of Interventional Radiology and Vascular Surgery, Peking University First Hospital, Beijing, China) ,  Niu Guochen (Department of Interventional Radiology and Vascular Surgery, Peking University First Hospital, Beijing, China) ,  Yan Ziguang (Department of Interventional Radiology and Vascular Surgery, Peking University First Hospital, Beijing, China) ,  Tong Xiaoqiang (Department of Interventional Radiology and Vascular Surgery, Peking University First Hospital, Beijing, China) ,  Zou Yinghua (Department of Interventional Radiology and Vascular Surgery, Peking University First Hospital, Beijing, China) ,  Yang Min (Department of Interventional Radiology and Vascular Surgery, Peking University First Hospital, Beijing, China)
資料名： Frontiers in Cardiovascular Medicine (Web)  (Frontiers in Cardiovascular Medicine (Web))
巻： 9  ページ： 864461  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7061A  ISSN： 2297-055X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:慢性四肢を脅かす虚血(CLTI)への間欠性跛行(IC)進行の病態生理学的機構は,まだ曖昧であり,ICの患者はCLTIになる。本研究は,ICとCLTIを識別するバイオマーカーをスクリーニングするため,末梢動脈疾患(PAD)患者の公開RNA配列決定データベースの定量的バイオインフォマティクス分析により,CLTIへのIC進行を仲介する重要な分子および経路を検討することを目的とした。方法:GSE120642データセットを,遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースからダウンロードした。ICとCLTI組織の間の差次的発現遺伝子(DEG)をRの「エッジR」パッケージを用いて分析した。遺伝子オントロジーと遺伝子およびゲノム濃縮分析の京都エンシクロペディアを,DEGの機能を調査するために実行した。蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを,相互作用遺伝子(STRING)データベースの検索のための検索ツールによって確立し,Cytoscopeソフトウェアによって可視化した。Hub遺伝子をプラグイン細胞Hubbaにより選択した。遺伝子セット濃縮分析を行い,受信者動作特性曲線を用いてハブ遺伝子の予測値を評価した。結果:合計137の上方制御と21の下方制御されたDEGを同定した。機能的濃縮クラスタ分析は,DEGと補体および凝固カスケード経路の間の有意な関連を明らかにした。PPIネットワークを155ノードと105の相互作用で構築した。最も有意に濃縮した経路は補体活性化であった。C1QB,C1QA,C1QC,C4A,およびC1Rを同定し,高い連結性によりハブ遺伝子として検証した。5つのハブ遺伝子の曲線値の下の面積は0.95より大きく,ICとCLTIを識別するための高い精度を示した。結論:補体活性化経路はCLTIへのIC進行と関連する。C1QB,C1QA,C1QC,C4A,およびC1RはCLTIの潜在的早期バイオマーカーとして役立つ可能性がある。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 凝固 ,  情報科学 ,  データベース ,  ネットワーク ,  生物学 ,  RNA【核酸】 ,  補体 ,  遺伝子 ,  可視化 ,  *虚血 ,  *サブユニット ,  病態生理 ,  ソフトウェア ,  遺伝子発現 ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 末梢動脈疾患 ,  間欠性 c行 ,  慢性下肢虚血 ,  補体 ,  機構 ,  生物情報学

分類 (3件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  循環系の基礎医学  (GJ01020K)

引用文献 (32件)：

• Sartipy F, Sigvant B, Lundin F, Wahlberg E. Ten year mortality in different peripheral arterial disease stages: a population based observational study on outcome. Eur J Vasc Endovasc Surg. (2018) 55:529-36. doi: 10.1016/j.ejvs.2018.01.019
• Conte MS, Bradbury AW, Kolh P, White JV, Dick F, et al. Global vascular guidelines on the management of chronic limb-threatening ischemia. Eur J Vasc Endovasc Surg. (2019) 58:S1-S109 e33. doi: 10.1016/j.ejvs.2019.05.006
• Kumakura H, Kanai H, Hojo Y, Iwasaki T, Ichikawa S. Long-term survival and fate of the leg in de novo intermittent claudication. Eur Heart J Qual Care Clin Outcomes. (2017) 3:208-15. doi: 10.1093/ehjqcco/qcw057
• Sigvant B, Lundin F, Wahlberg E. The risk of disease progression in peripheral arterial disease is higher than expected: a meta-analysis of mortality and disease progression in peripheral arterial disease. Eur J Vasc Endovasc Surg. (2016) 51:395-403. doi: 10.1016/j.ejvs.2015.10.022
• Ryan TE, Yamaguchi DJ, Schmidt CA, Zeczycki TN, Shaikh SR, Brophy P, et al. Extensive skeletal muscle cell mitochondriopathy distinguishes critical limb ischemia patients from claudicants. JCI Insight. (2018) 3:21. doi: 10.1172/jci.insight.123235

タイトルに関連する用語 (7件)： C1q ,  サブユニット ,  慢性 ,  四肢 ,  血栓 ,  虚血 ,  間欠