RT-qPCRによるSARS-CoV-2の検出に及ぼすプライマー結合部位における突然変異の影響のin vitro評価【JST・京大機械翻訳】

Zimmermann Fee; Urban Maria; Krueger Christian; Walter Mathias; Wolfel Roman; Zwirglmaier Katrin

文献

J-GLOBAL ID：202202259198330074 整理番号：22A0003115

RT-qPCRによるSARS-CoV-2の検出に及ぼすプライマー結合部位における突然変異の影響のin vitro評価【JST・京大機械翻訳】

In vitro evaluation of the effect of mutations in primer binding sites on detection of SARS-CoV-2 by RT-qPCR

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=22A0003115&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=22A0003115&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=E0807B") }}

著者 (6件)： , , , , ,
資料名：
巻： 299 ページ： Null 発行年： 2022年
JST資料番号： E0807B ISSN： 0166-0934 CODEN： JVMEDH 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

SARS-CoV-2の検出に対する多くのRT-qPCRアッセイが発表され,推奨アッセイとしてWHOによってリストされている。さらに,非閉鎖プライマーとプローブ配列による多数の市販アッセイは市場にある。SARS-CoV-2パンデミックの進行につれて,ウイルスは突然変異を起し,それはいくつかの場合において,B.1.1.7変異体で認められるように,SARS-CoV-2の他の菌株を凌駕し,プッシュする。突然変異がプライマーまたはプローブ結合部位で起こるならば,これはRT-qPCR結果に影響し,SARS-CoV-2診断を妨げる。ここでは,in vitro転写物における合成ミスマッチを用いて,in vitroでのRT-qPCR性能に及ぼすプライマーミスマッチの影響を試験した。ミスマッチの影響は-0.13から+7.61へのct値のシフトから変動した。明らかに,フォワードプライマーのミスマッチは,逆プライマーのミスマッチよりもPCR性能に対してより有害な影響を持つことを見出した。さらに,いくつかのあいまいさを持つ元のCharite RdRPプライマーセットの性能を,あいまいさのないプライマーバージョンで比較し,あいまいさなしに,ct値は約3ct低いことを見出した。最後に,著者らはB.1.1.7SARS-CoV-2変異体を持つSeegene Allplexキットで観察されたct値のシフトを調べ,N標的の前方プライマーにおいて3ヌクレオチドミスマッチを見出した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

, , , , ,
, 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： , , ,

微生物検査法

, , , , , ,

前のページに戻る