文献

J-GLOBAL ID：202202259337341726   整理番号：22A1023199

極低出生体重児のマイクロバイオームを形成する生態学的プロセス【JST・京大機械翻訳】

Ecological Processes Shaping Microbiomes of Extremely Low Birthweight Infants

著者 (9件)： Zioutis Christos (Division of Microbial Ecology, Department of Microbiology and Ecosystem Science, Centre for Microbiology and Environmental Systems Science, University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Seki David (Division of Microbial Ecology, Department of Microbiology and Ecosystem Science, Centre for Microbiology and Environmental Systems Science, University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Seki David (Division of Neonatology, Department of Pediatrics and Adolescent Medicine, Pediatric Intensive Care and Neuropediatrics, Comprehensive Center for Pediatrics, Medical University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Bauchinger Franziska (Division of Microbial Ecology, Department of Microbiology and Ecosystem Science, Centre for Microbiology and Environmental Systems Science, University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Herbold Craig (Division of Microbial Ecology, Department of Microbiology and Ecosystem Science, Centre for Microbiology and Environmental Systems Science, University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Berger Angelika (Division of Neonatology, Department of Pediatrics and Adolescent Medicine, Pediatric Intensive Care and Neuropediatrics, Comprehensive Center for Pediatrics, Medical University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Wisgrill Lukas (Division of Neonatology, Department of Pediatrics and Adolescent Medicine, Pediatric Intensive Care and Neuropediatrics, Comprehensive Center for Pediatrics, Medical University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Berry David (Division of Microbial Ecology, Department of Microbiology and Ecosystem Science, Centre for Microbiology and Environmental Systems Science, University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Berry David (Joint Microbiome Facility of the Medical University of Vienna, University of Vienna, Vienna, Austria)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 13  ページ： 812136  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトミクロビオームは早産児における健康転帰に影響するが,初期生命ミクロビオーム集合を支配する生態学的プロセスはよく理解されていない。ここでは,生命の最初の2週間にわたる超低出生体重児(ELBWI)における微生物群集集合と動態を検討した。16S rRNA遺伝子アンプリコン配列決定を用いて,経時的に腸,口腔および皮膚ミクロビオームをプロファイリングし,これらのミクロビオームを形成する生態学的力を評価した。全3体部位におけるミクロビオームは時間にわたる組成不安定性により特性化され,低体部位特異性(PERMANOVA,r2=0.09,p=0.001)を有したが,それらは4つの離散コミュニティ状態にクラスタ化できなかった。これらのコミュニティの揮発性にもかかわらず,決定論的集合プロセスは初期微生物コロニー形成のこの期間において検出可能であった。これらの決定論的動力学をさらに探求するために,著者らは,Markov過程として各ELBWIにおけるミクロビオーム状態遷移,または1つのコミュニティ状態から別のコミュニティ状態への”記憶無し”シフトをモデル化する確率的アプローチを開発した。この分析は,異なる身体部位からのミクロビオームが特徴的な平衡周波数と同様に特徴的な動力学を有することを明らかにした。早産児の時間分解ミクロビオームサンプリングは,臨床診療を洗練し,知らせるのを助ける可能性がある。さらに,本研究は,新生児ミクロビオームだけでなく,他のヒト関連または環境ミクロビオームにも,新しい洞察を容易にすることができるMarkovモデリングに基づく微生物群集動力学のための解析フレームワークを提供した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Markov過程 ,  微生物 ,  皮膚 ,  遺伝子 ,  口腔 ,  新生児 ,  腸 ,  ヒト ,  クラスタ化 ,  身体部位 ,  *生態学 ,  性質
準シソーラス用語： アンプリコン ,  部位特異性 ,  早産児 ,  微生物コンソーシアム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 新生児マイクロバイオーム ,  生態学的プロセス ,  コミュニティ状態 ,  Markovモデル ,  微生物群集構築

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (80件)：

• Afonso E. D. P., Blot S. (2017). Effect of gestational age on the epidemiology of late-onset sepsis in neonatal intensive care units - a review. Expert Rev Anti. Infe 15 917-924. doi: 10.1080/14787210.2017.1379394
• Arboleya S., Binetti A., Salazar N., Fernández N., Solís G., Hernández-Barranco A., et al (2012). Establishment and development of intestinal microbiota in preterm neonates. Fems Microbiol. Ecol. 79 763-772. doi: 10.1111/j.1574-6941.2011.01261.x
• Arumugam M., Raes J., Pelletier E., Paslier D. L., Yamada T., Mende D. R., et al (2011). Enterotypes of the human gut microbiome. Nature 473 174-180. doi: 10.1038/nature09944
• Aujoulat F., Roudière L., Picaud J.-C., Jacquot A., Filleron A., Neveu D., et al (2014). Temporal dynamics of the very premature infant gut dominant microbiota. BMC Microbiol. 14:325. doi: 10.1186/s12866-014-0325-0
• Bäckhed F., Roswall J., Peng Y., Feng Q., Jia H., Kovatcheva-Datchary P., et al (2015). Dynamics and Stabilization of the Human Gut Microbiome during the First Year of Life. Cell Host Microbe 17 690-703. doi: 10.1016/j.chom.2015.04.004

タイトルに関連する用語 (4件)： 極低出生体重児 ,  マイクロバイオーム ,  生態 ,  プロセス