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J-GLOBAL ID：202202260096323594   整理番号：22A1024272

Bombyx moriにおけるscRNA-Seqにより定義される血球クラスタ:予測マーカー遺伝子のin silico解析および潜在的機能的役割に対する意味【JST・京大機械翻訳】

Hemocyte Clusters Defined by scRNA-Seq in Bombyx mori: In Silico Analysis of Predicted Marker Genes and Implications for Potential Functional Roles

著者 (3件)： Feng Min (1Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding, College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou, China) ,  Swevers Luc (2Insect Molecular Genetics and Biotechnology, Institute of Biosciences & Applications, National Centre for Scientific Research “Demokritos”, Aghia Paraskevi, Athens, Greece) ,  Sun Jingchen (1Guangdong Provincial Key Laboratory of Agro-animal Genomics and Molecular Breeding, College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou, China)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 13  ページ： 852702  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 血リンパ内では,昆虫血球は先天性免疫,ホメオスタシスおよび発生において重要な役割を果たすマクロファージ様細胞の不均一な集団を構成する。サイズ,形態,および生化学または免疫学的マーカーによる異なるサブタイプにおける血球の分類は困難であり,ショウジョウバエの広範な遺伝子分析でのみ,赤血球から顆粒球,結晶細胞,および形質細胞への血球分化のコヒーレント像の構築を可能にした。しかしながら,単一細胞RNA配列決定(scRNA-seq)のようなハイスループット単一細胞技術の出現は,精巧な遺伝的ツールボックスが利用できない他の昆虫における血球サブタイプおよびそれらの表現型の研究に対して,高い影響を有する。バルクRNA-seqにおいて生じるように,すべての細胞にわたって遺伝子発現を平均化する代わりに,scRNA-seqは,個々の細胞の分化状態のハイスループットおよび特異的可視化を可能にする。scRNA-seqにより,興味深い細胞型が不均一集団で同定でき,希少細胞型の直接解析が可能である。組織試料中の個々の細胞のトランスクリプトームをプロファイルするその能力に次いで,scRNA-seqを用いて異なる血球サブタイプの特徴であるマーカー遺伝子を提案し,それらの機能を予測することができる。この展望において,カイコ,Bombyxモリンの幼虫における血球の13の異なる細胞クラスタを定義するために,scRNA-seq解析により同定された異なるマーカー遺伝子の同一性を詳細に論じた。分析は,顆粒球,形質細胞,エノシトイドおよび恐らく球状赤血球における血球の広範な分裂を確認したが,分子レベルおよび高度に特殊化した機能でかなりの複雑性を明らかにした。さらに,Bombyxにおける血球マーカー遺伝子の予測は,ショウジョウバエの血球サブタイプの特徴と考えられる遺伝子による限られた収束のみを示す。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 赤血球 ,  *RNA【核酸】 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  *血球 ,  細胞 ,  表現型 ,  可視化 ,  ホメオスタシス ,  ショウジョウバエ ,  遺伝子発現 ,  細胞分化
準シソーラス用語： *Bombyx ,  単一細胞 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： scRNA-seq ,  カイコ ,  血液細胞 ,  マーカー遺伝子 ,  Bombyx mori

分類 (4件)： 生体防御と免疫系研究法  (ED01020Q) ,  生体防御と免疫系一般  (ED01010F) ,  血液検査  (GC02050D) ,  免疫反応一般  (ED03010T)

引用文献 (264件)：

• Lavine MD, Strand MR. Insect Hemocytes and Their Role in Immunity. Insect Biochem Mol Biol (2002) 32:1295-309. doi: doi: 10.1016/S0965-1748(02)00092-9
• Hartenstein V. Blood Cells and Blood Cell Development in the Animal Kingdom. Annu Rev Cell Dev Biol (2006) 22:677-712. doi: doi: 10.1146/annurev.cellbio.22.010605.093317
• Hartenstein V. One Too Many: The Surprising Heterogeneity of Drosophila Macrophages. EMBO J (2020) 39:e105199. doi: doi: 10.15252/embj.2020105199
• Cattenoz PB, Sakr R, Pavlidaki A, Delaporte C, Riba A, Molina N, et al. Temporal Specificity and Heterogeneity of Drosophila Immune Cells. EMBO J (2020) 39:e104486. doi: doi: 10.15252/embj.2020104486
• Tattikota SG, Cho B, Liu YF, Hu Y, Barrera V, Steinbaugh MJ, et al. A Single-Cell Survey of Drosophila Blood. Elife (2020) 9:e54818. doi: doi: 10.7554/eLife.54818

タイトルに関連する用語 (8件)： 定義 ,  血球 ,  クラスタ ,  予測 ,  マーカー遺伝子 ,  解析 ,  役割 ,  意味