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J-GLOBAL ID：202202260470849737   整理番号：22A0490123

3つの中等度分化声門上LSCC患者からのCAF由来エキソソームmiRNAの異常発現プロファイルとバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Aberrant expression profiles and bioinformatic analysis of CAF-derived exosomal miRNAs from three moderately differentiated supraglottic LSCC patients

著者 (7件)： Wu Chunping (Department of Otorhinolaryngology Head and Neck Surgery, Shanghai Key Clinical Disciplines of Otorhinolaryngology, Eye & ENT Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Wang Mei (Department of Otolaryngology, Shanghai Municipal Hospital of Traditional Chinese Medicine, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai, China) ,  Huang Qiang (Department of Otorhinolaryngology Head and Neck Surgery, Shanghai Key Clinical Disciplines of Otorhinolaryngology, Eye & ENT Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Guo Yang (Department of Otorhinolaryngology Head and Neck Surgery, Shanghai Key Clinical Disciplines of Otorhinolaryngology, Eye & ENT Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Gong Hongli (Department of Otorhinolaryngology Head and Neck Surgery, Shanghai Key Clinical Disciplines of Otorhinolaryngology, Eye & ENT Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Hu Chunyan (Department of Pathology, Eye & ENT Hospital of Fudan University, Shanghai, China) ,  Zhou Liang (Department of Otorhinolaryngology Head and Neck Surgery, Shanghai Key Clinical Disciplines of Otorhinolaryngology, Eye & ENT Hospital of Fudan University, Shanghai, China)
資料名： Journal of Clinical Laboratory Analysis  (Journal of Clinical Laboratory Analysis)
巻： 36  号： 1  ページ： e24108  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2635A  ISSN： 0887-8013  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:エキソソームmiRNAの異常な発現は研究ホットスポットとして出現している。しかし,声門上喉頭扁平上皮癌(SLSCC)における癌関連線維芽細胞(CAFs)由来のエキソソームmiRNAの調節不全に関する研究は行われていない。方法:SLSCC患者由来の癌関連線維芽細胞および対正常線維芽細胞(NF)を培養し,培養上清のエキソソームを採取し,同定した。エキソソームmiRNA発現を次世代配列決定によりCAFsとNFの各対で比較し,選択したエキソソームmiRNAの発現を逆転写-定量的PCRにより検証した。4つのオンラインバイオインフォマティクスアルゴリズムは,異常に発現したmiRNAの潜在的標的遺伝子を予測し,一方,遺伝子オントロジーと遺伝子およびゲノム(KEGG)経路濃縮とネットワーク解析は,下流標的遺伝子とそれらの相互作用を同定した。結果:3対のCAFsとNFsを培養して精製した。CAF由来エキソソームmiRNAはほとんどダウンレギュレートされ,miR-656-3p,miR-337-5p,miR-29a-3pおよびmiR-655-3p;しかし,miR-184-3p,miR-92a-1-5p,miR-212-3pおよびmiR-3135bを含むいくつかのものはアップレギュレートされた。バイオインフォマティクス解析は,生物学的プロセス,細胞成分および分子機能におけるこれらのmiRNAの関与を明らかにした。KEGG分析は,癌開始と進行および細胞周期調節におけるトップ30経路の関与を明らかにした。相互作用ネットワークはmiR-16-5p,miR-29a-3p,miR-34c-5p,miR-32-5p及びmiR-490-5pを上位5つのmiRNA及びCCND1,CDKN1B,CDK6,PTEN及びFOSを上位5標的遺伝子として示した。結論:SLSCC患者はCAF由来エキソソームmiRNAの異常発現を示した。上位5つのmiRNAとそれらの標的遺伝子は,発癌性腫瘍微小環境を一緒に構成し,SLSCC介入のためのバイオマーカーとして作用する可能性がある。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  相互作用 ,  ネットワーク ,  遺伝子 ,  線維芽細胞 ,  *分化 ,  細胞構成体 ,  バイオマーカー ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  *バイオインフォマティクス ,  *エキソソーム ,  標的遺伝子 ,  遺伝子オントロジー ,  KEGG , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 癌関連線維芽細胞 ,  エキソソーム ,  喉頭扁平上皮癌 ,  miRNA ,  声門上声門

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： 分化 ,  声門 ,  患者 ,  CAF ,  エキソソーム ,  miRNA ,  発現プロファイル ,  バイオインフォマティクス解析