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J-GLOBAL ID：202202260729918627   整理番号：22A0411426

葉代謝のハイブリッド速度論および拘束ベースモデルは異なる環境における代謝フラックスの予測を可能にする【JST・京大機械翻訳】

A hybrid kinetic and constraint-based model of leaf metabolism allows predictions of metabolic fluxes in different environments

著者 (7件)： Shameer Sanu (Department of Plant Sciences, University of Oxford, South Parks Road, Oxford, OX1 3RB, UK) ,  Wang Yu (Carl R Woese Institute for Genomic Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL, 61801, USA) ,  Bota Pedro (Department of Plant Sciences, University of Oxford, South Parks Road, Oxford, OX1 3RB, UK) ,  Ratcliffe R. George (Department of Plant Sciences, University of Oxford, South Parks Road, Oxford, OX1 3RB, UK) ,  Long Stephen P. (Carl R Woese Institute for Genomic Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL, 61801, USA) ,  Long Stephen P. (Lancaster Environment Centre, Lancaster University, Lancaster, LA1 4YQ, UK) ,  Sweetlove Lee J. (Department of Plant Sciences, University of Oxford, South Parks Road, Oxford, OX1 3RB, UK)
資料名： Plant Journal  (Plant Journal)
巻： 109  号： 1  ページ： 295-313  発行年： 2022年 
JST資料番号： A1374A  ISSN： 0960-7412  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： フラックスバランス解析(FBA)は,定常状態の葉代謝ネットワークフラックスを予測するためのフレームワークを提供するが,他のモデリング定式化と結合せずに環境変数に対する応答を容易に捉えることはできない。これに取り組むために,ダイズ(Glycine max)葉代謝の903反応のFBAモデルを,光合成の126反応の速度論と関連する葉緑体炭素代謝を捉える動的モデルであるe-光合成と結合させた。e-光合成からのフラックスを用いてFBAモデルを制約し,次に,e-光合成におけるパラメータ更新に用いたFBAモデルから計算したフラックスを,逐次定式化において達成した。このプロセスを2つのモデルで収束する共通のフラックスまで繰り返した。カップリングは,2つのCO_2濃度における圃場成長ダイズの炭素同化速度,光化学系II電子フラックス,および澱粉蓄積を正確に予測するための速度論モジュールの能力を妨げなかった。結合モデルはまた,夜間呼吸のような付加的パラメータの正確な予測と,葉代謝に対する光強度とCO_2上昇の影響の解析を可能にした。予測は,高光での葉からのショ糖の輸出速度における予想外の減少を含み,これは澱粉-スクロース分配の変化,及び高CO_2でのトリカルボン酸サイクルにおける日中フラックスモードの変化によるものであった。ミトコンドリアフラックスは増殖と成熟葉の間で顕著に異なり,前者で予測された大きなアンペローシス,トリカルボン酸サイクルとミトコンドリアATPシンターゼフラックスは主に蛋白質合成のための炭素骨格とエネルギーを提供した。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 炭素 ,  クエン酸サイクル ,  葉緑体 ,  光合成 ,  *ダイズ ,  炭酸同化 ,  澱粉 ,  ミトコンドリア ,  ダイナミックモデル ,  定式化 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  二糖類 ,  ピラノシド ,  フラノシド ,  グルコシド ,  フルクトオリゴ糖
準シソーラス用語： 光強度 ,  代謝ネットワーク ,  炭素代謝 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 技術的進歩 ,  代謝モデリング ,  フラックスバランス解析 ,  動力学モデリング ,  Glycine max ,  中枢炭素代謝

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  光合成  (EB10020I)

物質索引 (2件)： グリシン ,  蔗糖

タイトルに関連する用語 (8件)： 葉 ,  代謝 ,  速度論 ,  拘束 ,  モデル ,  環境 ,  代謝フラックス ,  予測