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J-GLOBAL ID：202202260868288859   整理番号：22A0297421

新しいミトコンドリアCOIプライマーと配列により明らかにされたCtenophoraの隠れた多様性【JST・京大機械翻訳】

Hidden diversity of Ctenophora revealed by new mitochondrial COI primers and sequences

著者 (5件)： Christianson Lynne M. (Monterey Bay Aquarium Research Institute, Moss Landing, CA, USA) ,  Johnson Shannon B. (Monterey Bay Aquarium Research Institute, Moss Landing, CA, USA) ,  Schultz Darrin T. (Monterey Bay Aquarium Research Institute, Moss Landing, CA, USA) ,  Schultz Darrin T. (Department of Biomolecular Engineering and Bioinformatics, University of California, Santa Cruz, CA, USA) ,  Haddock Steven H. D. (Monterey Bay Aquarium Research Institute, Moss Landing, CA, USA)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 22  号： 1  ページ： 283-294  発行年： 2022年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ミトコンドリア遺伝子チトクロームc-オキシダーゼサブユニット1(COI)は,系統発生,個体群遺伝学,メタバーコーディング,および迅速な種同定のための多くの分類群において有用である。しかし,Ctenophora門(comb jellies)は,分岐したミトコンドリア配列と,変性および標準COI「バーコーディング」プライマーによるCOI増幅の対応不能性のために,歴史的に研究が困難である。結果として,門の200の記載された種にもかかわらず,テノホアに利用可能なCOI配列は非常に少ない。ここでは,新しいプライマーを設計し,多くの未記載種を含む,全ての主要グループメンバーからCOIフラグメントを増幅した。得られたCOI配列の系統発生解析は,より保存された18S rDNA配列からは明らかではない多くのグループ内で,特にLobata(Ctenophora;Tentaculata;Lobata)の間で高い多様性を明らかにした。また,COI系統学的結果は,Bolinopsis属内の予想外の群集構造を明らかにし,Bathocyroe属内の新種を示唆し,Lampocteis cruentiventerおよび類似の非記述葉酸塩(Lampocteis sp.”V”)のようないくつかの種の生態学的および形態学的差異を,深さによって層別化し,「A」を色によって区別した。ここで報告した新しく設計したプライマーは,研究者が,迅速な分子同定により世界中のctenophorの多様性を解明できる重要なツールを提供し,参照ライブラリーと増幅を改善することにより環境DNAを分析する能力を改善し,集団遺伝学的研究の新しい幅を可能にする。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 符号化 ,  *ミトコンドリア ,  系統発生 ,  *有櫛動物 ,  集団遺伝 ,  生態学 ,  バーコード ,  ミトコンドリア遺伝子 ,  *プライマー【遺伝】 ,  チトクロームcオキシダーゼ ,  新種 ,  生物多様性 ,  モルフォロジー
準シソーラス用語： 種判別 ,  分類群 ,  バーコーディング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： バーコード ,  生物多様性 ,  Ctenophora ,  チトクロームcオキシダーゼ ,  eDNA ,  メタバーコーディング ,  プライマー

分類 (1件)： 動物分類学  (EJ01030T)

タイトルに関連する用語 (5件)： ミトコンドリア ,  COI ,  プライマー ,  Ctenophora ,  多様性