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J-GLOBAL ID：202202261084540184   整理番号：22A1030112

下方制御ADH1Cの同定はバイオインフォマティクス解析を用いた結腸直腸癌における予後不良と関連する【JST・京大機械翻訳】

Identification of Down-Regulated ADH1C is Associated With Poor Prognosis in Colorectal Cancer Using Bioinformatics Analysis

著者 (8件)： Li Ming (1School of Basic Medical Sciences, Hebei University, Baoding, China) ,  Liu Ziming (2College of Clinical Medicine, Hebei University, Baoding, China) ,  Song Jia (1School of Basic Medical Sciences, Hebei University, Baoding, China) ,  Wang Tian (2College of Clinical Medicine, Hebei University, Baoding, China) ,  Wang Hongjie (1School of Basic Medical Sciences, Hebei University, Baoding, China) ,  Wang Hongjie (3Affiliated Hospital of Hebei University, Baoding, China) ,  Wang Yanan (4Department of Pathology, Affiliated Hospital of Hebei University, Baoding, China) ,  Guo Jiguang (1School of Basic Medical Sciences, Hebei University, Baoding, China)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 791249  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結腸直腸癌(CRC)は全世界で2番目に死亡する癌であり,根本的なメカニズムは主に不明瞭である。したがって,バイオインフォマティクス法を用いてCRCの開始,形成および予後不良に関与する重要な経路および遺伝子を同定することを目的とした。本研究では,3つのチップデータセット(GSE33113,GSE23878およびGSE41328)から正常な結腸直腸組織からのそれらとCRC症例の遺伝子発現プロファイルを比較し,3つのデータセットに共通する105の差次的発現遺伝子(DEG)を同定した。遺伝子オントロジーおよび遺伝子およびゲノム経路分析は,上方制御されたDEGの最も高い割合が細胞外領域およびサイトカイン-サイトカイン受容体相互作用経路に関与することを示した。膜および胆汁分泌経路の積分成分は,下方制御されたDEGを含むと同定された。13のハブDEGを選択し,それらの発現をGEPIAによってさらに検証した。4つのDEG(ADH1C,CLCA4,CXCL8およびGUCA2A)のみが,予後分析後に有意に低い全生存率と関連していた。低いADH1C蛋白質レベルとより高いCXCL8蛋白質レベルを,臨床CRCと正常結腸直腸組織で免疫組織化学染色とウェスタンブロットによって確かめた。結論として,著者らの研究は,細胞外腫瘍微小環境と胆汁代謝経路がCRCの形成と進行において重要な役割を果たすことを示した。さらに,ADH1CがCRCでダウンレギュレートされ,初めて,ADH1Cが予後予測因子として報告されたことを確認した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  遺伝子 ,  胆汁 ,  代謝経路 ,  生存率 ,  *予後 ,  遺伝子発現 ,  *ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  サイトカイン ,  *結腸腫瘍 ,  *直腸腫瘍 ,  オントロジー
準シソーラス用語： *予後不良 ,  予後因子 ,  *結腸直腸癌 ,  全生存率 ,  遺伝子オントロジー ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ADH1C ,  バイオインフォマティクス解析 ,  遺伝子発現Omnibusデータベース ,  結腸直腸癌 ,  差次的発現遺伝子

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (55件)：

• AnantharamanD., ChabrierA., GaborieauV., FranceschiS., HerreroR., RajkumarT., et al (2014). Genetic Variants in Nicotine Addiction and Alcohol Metabolism Genes, Oral Cancer Risk and the Propensity to Smoke and Drink Alcohol: a Replication Study in India. PLoS One 9 (2), e88240. doi: 10.1371/journal.pone.0088240
• AnayaJ. (2016). OncoLnc: Linking TCGA Survival Data to mRNAs, miRNAs, and lncRNAs. PeerJ Comput. Sci. 2, e67. doi: 10.7717/peerj-cs.67
• AshburnerM., BallC. A., BlakeJ. A., BotsteinD., ButlerH., CherryJ. M., et al (2000). Gene Ontology: Tool for the Unification of Biology. Nat. Genet. 25 (1), 25-29. doi: 10.1038/75556
• BaciD., BrunoA., CasciniC., GallazziM., MortaraL., SessaF., et al (2019). Acetyl-L-Carnitine Downregulates Invasion (CXCR4/CXCL12, MMP-9) and Angiogenesis (VEGF, CXCL8) Pathways in Prostate Cancer Cells: Rationale for Prevention and Interception Strategies. J. Exp. Clin. Cancer Res. 38 (1), 464. doi: 10.1186/s13046-019-1461-z
• BashirB., MerlinoD. J., RappaportJ. A., GnassE., PalazzoJ. P., FengY., et al (2019). Silencing the GUCA2A-Gucy2c Tumor Suppressor axis in CIN, Serrated, and MSI Colorectal Neoplasia. Hum. Pathol. 87, 103-114. doi: 10.1016/j.humpath.2018.11.032

タイトルに関連する用語 (5件)： 下方制御 ,  同定 ,  バイオインフォマティクス解析 ,  結腸直腸癌 ,  予後不良