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J-GLOBAL ID：202202261576608653   整理番号：22A0568594

トランスクリプトーム解析はゴールデンポンパノ(Trachinotus blochii)における精巣と卵巣間の差次的発現長鎖非コードRNAへの洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome analysis provides insights into differentially expressed long noncoding RNAs between the testis and ovary in golden pompano (Trachinotus blochii)

著者 (8件)： Song Feibiao (State Key Laboratory of Marine Resource Utilization in South China Sea, Hainan Aquaculture Breeding Engineering Research Center, Hainan Academician Team Innovation Center, Hainan University, Haikou 570228, China) ,  Gu Yue (State Key Laboratory of Marine Resource Utilization in South China Sea, Hainan Aquaculture Breeding Engineering Research Center, Hainan Academician Team Innovation Center, Hainan University, Haikou 570228, China) ,  Chen Youming (Hainan Blue Granary Technology Co., Ltd, Sanya 572025, China) ,  Zhang Kaixi (State Key Laboratory of Marine Resource Utilization in South China Sea, Hainan Aquaculture Breeding Engineering Research Center, Hainan Academician Team Innovation Center, Hainan University, Haikou 570228, China) ,  Shi Liping (State Key Laboratory of Marine Resource Utilization in South China Sea, Hainan Aquaculture Breeding Engineering Research Center, Hainan Academician Team Innovation Center, Hainan University, Haikou 570228, China) ,  Sun Junlong (State Key Laboratory of Marine Resource Utilization in South China Sea, Hainan Aquaculture Breeding Engineering Research Center, Hainan Academician Team Innovation Center, Hainan University, Haikou 570228, China) ,  Zhang Zhijie (State Key Laboratory of Marine Resource Utilization in South China Sea, Hainan Aquaculture Breeding Engineering Research Center, Hainan Academician Team Innovation Center, Hainan University, Haikou 570228, China) ,  Luo Jian (State Key Laboratory of Marine Resource Utilization in South China Sea, Hainan Aquaculture Breeding Engineering Research Center, Hainan Academician Team Innovation Center, Hainan University, Haikou 570228, China)
資料名： Aquaculture Reports  (Aquaculture Reports)
巻： 22  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： W3063A  ISSN： 2352-5134  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 金 po(Trachinotus blochii)は熱帯および亜熱帯水域に広く分布する暖水魚である。T.blochiiは,海洋ケージ養殖で生産される中国で最も重要な経済種の1つである。しかし,性決定と分化の機構に関する研究はほとんど行われておらず,男性と女性の間には明らかな形態学的差異がない。T.blochiiの性決定と生殖腺発生における長い非コードRNA(lncRNA)の役割をさらに理解するために,T.blochii卵巣と精巣のトランスクリプトーム解析を行った。本研究では,厳密なフィルタリング後,6つのcDNAライブラリーから合計530,128,262の清潔な読取りを作製した。RNA-seq分析は,13,509の新規なlncRNA,2621の新規mRNA,および18,683の既知のmRNA転写物を4909と10,410の差次的に発現したlncRNAとmRNAを産出した。lncRNAとmRNA間の遺伝子オントロジー(GO)濃縮パターンは異なった。遺伝子およびゲノム(KEGG)分析の京都エンシクロペディアは,lncRNAの差次的に発現したmRNAおよび標的遺伝子のいくつかが,主に,GnRHシグナリング経路,Wntシグナリング経路およびインシュリンシグナリング経路を含む,何種類かの性決定および生殖腺発達シグナリング経路と関係することを確認した。lncRNA-mRNA共発現ネットワーク解析は,lncRNA TCONS_00083175がT.blochii性分化において鍵となる役割を果たすことを示した。この知見はlncRNAと生殖腺遺伝学の理解を広げ,性分化におけるlncRNAの機能への新たな洞察を提供し,将来の研究のための重要なlncRNAを強調する。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： mRNA ,  遺伝子 ,  魚類 ,  *精巣 ,  *卵巣 ,  海洋 ,  養殖 ,  熱帯 ,  生殖腺 ,  *遺伝学実験技術 ,  遺伝子発現 ,  モルフォロジー ,  性腺刺激ホルモン放出ホルモン
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 ,  共発現 ,  *差次的遺伝子発現 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Trachinotusブロチイ ,  生殖腺 ,  LncRNA ,  性分化

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  動物性水産食品  (FJ13020C)

タイトルに関連する用語 (6件)： トランスクリプトーム解析 ,  精巣 ,  卵巣 ,  差次的発現 ,  長鎖非コードRNA ,  洞察