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J-GLOBAL ID：202202261645545616   整理番号：22A0453310

ダイズにおけるSclerotinia sclerotiorumに対する耐性に関与する候補遺伝子ネットワークの検出【JST・京大機械翻訳】

Detection of candidate gene networks involved in resistance to Sclerotinia sclerotiorum in soybean

著者 (5件)： Zhang Yu (School of Biological Sciences and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong, Shaanxi, China) ,  Wang Yuexing (College of Agronomy, Xinjiang Agricultural University, Urumqi, China) ,  Zhou Wanying (School of Biological Sciences and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong, Shaanxi, China) ,  Zheng Shimao (School of Biological Sciences and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong, Shaanxi, China) ,  Ye Runzhou (Faculte de Medecine Et Des Sciences de La Sante, Universite de Sherbrooke, Sherbrooke, QC, Canada)
資料名： Journal of Applied Genetics  (Journal of Applied Genetics)
巻： 63  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2022年 
JST資料番号： A0889A  ISSN： 1234-1983  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 量的形質遺伝子座(QTL)マッピングはしばしば多様な因子の結果として異なる遺伝子座/遺伝子と関連する。マッピング研究間の非常に限られた一致が観察された1つの形質は,ダイズにおける白かびに対する耐性である。単一データセットに適用した異なるアプローチが,より一貫した結果をもたらすかどうかを探索するため,ハプロタイプ-形質会合とエピスタシス相互作用効果を,より従来のマーカー-形質解析に対する補完として検討した。少なくとも10のゲノム領域はダイズにおけるSclerotinia sclerotiorum耐性と有意に関連していたが,これはこれまで報告されていない。α=0.05の有意性レベルで,ハプロタイプ-形質会合は,最も顕著なシグナルが染色体17上の4-SNP(一塩基多型)を有するハプロタイプから生じ,単一SNP-形質分析は染色体3上の位置rs34387780のヌクレオチド多型に位置することを示した。各染色体のピーク-SNP(p値<0.05)の全ては,それぞれのハプロタイプで現れた。極端な表現型を有する試料は,関連研究のために単一アウトアウトし,表現型スペクトルの各端から25~30%が,本研究において,最も適切な試料サイズであった。エピスタシス相互作用解析によりいくつかの鍵となる遺伝子を同定した。最も近い位置遺伝子に関する情報を結合することにより,ほとんどの遺伝子座はこれまで報告されていないことを示した。遺伝子オントロジー(GO)および遺伝子およびゲノム(KEGG)濃縮分析は,植物病原体相互作用経路と同様に,細胞壁およびマイトジェン活性化蛋白質キナーゼ(MAPK)シグナル伝達経路植物におけるカロース沈着の根底にある潜在的候補遺伝子を示唆する。多方法ゲノムワイド関連研究(GWAS)の統合は,新しいゲノム領域および新しい領域における有望な候補遺伝子を明らかにし,それぞれ,Glyma.01g048500,Glyma.03g129100,Glyma.17g072200,および染色体1,3,7および20上の蛋白質のDishevelled(Dvl)ファミリーを含む。Copyright The Author(s) 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *ネットワーク ,  *遺伝子 ,  染色体 ,  *ダイズ ,  タンパク質 ,  ヌクレオチド ,  表現型 ,  ゲノム ,  ハプロタイプ ,  量的形質遺伝子座 ,  一塩基多型 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： 上位性 ,  *候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 菌核病菌 ,  SNP ,  ハプロタイプ ,  エピスタシス ,  ポストGWAS

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： ダイズ ,  Sclerotinia ,  耐性 ,  遺伝子ネットワーク