文献

J-GLOBAL ID：202202261811555371   整理番号：22A0449369

図書館準備中に発生するデータ汚染の洗浄に助けられたインラインインデックスとその後のステップ【JST・京大機械翻訳】

Inline index helped in cleaning up data contamination generated during library preparation and the subsequent steps

著者 (8件)： Wang Ying (Shanghai Universities Key Laboratory of Marine Animal Taxonomy and Evolution, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Wang Ying (Shanghai Collaborative Innovation for Aquatic Animal Genetics and Breeding, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Yuan Hao (Shanghai Universities Key Laboratory of Marine Animal Taxonomy and Evolution, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Yuan Hao (Shanghai Collaborative Innovation for Aquatic Animal Genetics and Breeding, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Huang Junman (Shanghai Universities Key Laboratory of Marine Animal Taxonomy and Evolution, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Huang Junman (Shanghai Collaborative Innovation for Aquatic Animal Genetics and Breeding, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Li Chenhong (Shanghai Universities Key Laboratory of Marine Animal Taxonomy and Evolution, Shanghai Ocean University, Shanghai, China) ,  Li Chenhong (Shanghai Collaborative Innovation for Aquatic Animal Genetics and Breeding, Shanghai Ocean University, Shanghai, China)
資料名： Molecular Biology Reports  (Molecular Biology Reports)
巻： 49  号： 1  ページ： 385-392  発行年： 2022年 
JST資料番号： W4741A  ISSN： 1573-4978  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ハイスループット配列決定は,ライブラリー調製と増幅段階を含み,サンプルまたは試料間または環境間で汚染を誘発する可能性がある。方法:著者らは,データ汚染問題を解決するために,ライブラリープレップの結紮ステップで挿入物の両端に6bpのDNA指数を加えたインライン指数戦略の適用の効果を試験した。結果:結果は,汚染が1つの実験で0.29から1.25%,他方で0.83から27.01%の範囲であることを示した。また,汚染は,試料間の交差汚染に加えて,環境または試薬に由来することを見出した。結論:インライン指数法は,データを浄化するための有用な実験計画であり,多くの応用において高スループット配列決定データを pす汚染問題に対処する。Copyright The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature B.V. 2021 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 実験計画法 ,  DNA【核酸】 ,  *結紮術
準シソーラス用語： 交差汚染 ,  ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 汚染 ,  交差汚染 ,  インデクシング ,  次世代シークエンシング ,  環境DNA ,  系統ゲノミクス ,  Metaゲノミクス ,  多重配列決定

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 図書館 ,  汚染 ,  洗浄 ,  インライン ,  インデックス