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J-GLOBAL ID：202202262001595744   整理番号：22A0944767

シェルフライフの対照的な遺伝子型の果実転写プロファイリングはキュウリの収穫後生物学を調節する重要な候補遺伝子と分子経路を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Fruit transcriptional profiling of the contrasting genotypes for shelf life reveals the key candidate genes and molecular pathways regulating post-harvest biology in cucumber

著者 (14件)： Pradeepkumara N. (Division of Vegetable Science, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Sharma Parva Kumar (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi, India) ,  Munshi A.D. (Division of Vegetable Science, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Behera T.K. (Division of Vegetable Science, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Bhatia Reeta (Division of Floriculture and Landscaping, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Kumari Khushboo (Division of Vegetable Science, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Singh Jogendra (Division of Vegetable Science, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Jaiswal Sarika (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi, India) ,  Iquebal Mir Asif (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi, India) ,  Arora Ajay (Division of Plant Physiology, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India) ,  Rai Anil (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi, India) ,  Kumar Dinesh (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi, India) ,  Bhattacharya R.C. (ICAR-National Institute of Plant Biotechnology, New Delhi, India) ,  Dey S.S. (Division of Vegetable Science, ICAR-Indian Agricultural Research Institute, New Delhi, India)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 114  号： 2  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： キュウリ果実は自然界で腐敗し,収穫の2~3日以内に市場に不適になる。例外的に高いシェルフライフを有する天然変異体DC-48を開発し,初めてRNA-seqによる延長シェルフライフに対する遺伝的構造と分子機構を精査した。全部で1364のDEGを同定し,細胞壁分解,クロロフィルおよびエチレン代謝関連遺伝子が主要な役割を果たした。ポリガラクターナーゼ(PG),エクスパンシン(EXP)及びキシログルカンは果実硬度をダウンレギュレートし,新鮮緑色の保持は主にクロロフィル触媒酵素(CCE)の低発現レベルに起因した。遺伝子調節ネットワークは,多様な生物学的過程に関連したハブ遺伝子とクロストークを明らかにした。多数のSSRs(21524),SNP(545173)およびInDels(126252)は,キュウリ改良の手段になるであろう。Webゲノム資源であるCsExSLDbは,キュウリポストハーベスト生物学に関する将来の研究のためのプラットフォームを提供するであろう。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酵素 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  *遺伝子型 ,  *キュウリ ,  *果物 ,  クロロフィル ,  細胞壁 ,  代謝 ,  グルカン ,  遺伝学実験技術 ,  Web【情報システム】
準シソーラス用語： キシログルカン ,  *候補遺伝子 ,  *転写プロファイリング ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： キュウリ ,  発達段階 ,  シェルフライフ ,  RNA-seq ,  GO分析 ,  KEGG経路 ,  変異体同定 ,  遺伝子調節ネットワーク ,  Web資源

分類 (1件)： 果実とその加工品  (FJ11030Z)

タイトルに関連する用語 (11件)： シェルフライフ ,  対照 ,  遺伝子型 ,  果実 ,  転写プロファイリング ,  キュウリ ,  収穫 ,  生物学 ,  調節 ,  候補遺伝子 ,  分子経路