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J-GLOBAL ID：202202262414688112   整理番号：22A1030206

全エクソーム配列決定に基づくモヤモヤ病家族の突然変異遺伝子TTNのスクリーニングに関するCRISPR検出と研究【JST・京大機械翻訳】

CRISPR Detection and Research on Screening Mutant Gene TTN of Moyamoya Disease Family Based on Whole Exome Sequencing

著者 (9件)： Xiao Yilei (1Department of Neurosurgery, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, China) ,  Liu Weidong (1Department of Neurosurgery, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, China) ,  Hao Jiheng (1Department of Neurosurgery, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, China) ,  Jiang Qunlong (1Department of Neurosurgery, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, China) ,  Wang Xingbang (2Department of Geriatric Medicine, Qilu Hospital of Shandong University, Ji’nan, China) ,  Yu Donghu (3Department of Neurosurgery, Zhongnan Hospital of Wuhan University, Wuhan, China) ,  Zhang Liyong (1Department of Neurosurgery, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, China) ,  Dong Zhaogang (4Department of Clinical Laboratory, Qilu Hospital of Shandong University, Ji’nan, China) ,  Wang Jiyue (1Department of Neurosurgery, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, China)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 9  ページ： 846579  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： モヤモヤ病(MMD)はアジア人集団において高い発生率を有し,ある程度の家族性クラスタ化を示す。全ゲノム配列決定(WES)は家族性遺伝病における重要な関連遺伝子の確立に有用であるが,時間がかかり費用がかかる。したがって,新しい方法の探索はMMDの診断にとってより効果的である。著者らは,MMD感受性を示す家族性コホートを同定し,5人の影響を受けた個人に対してWESを実施し,タイチン(TTN)遺伝子(rs771533925,rs559712998およびrs72677250)における点突然変異部位を同定した。さらに,TTN突然変異は,50の散発性MMD症例のコホートで見つからなかった。また,変異頻度を分析し,疾患相関の突然変異有害性,機能および確率を明らかにするために生物情報学的予測を用い,結果は,rs771533925およびrs72677250が,MMD病因と関係した各種の生物学的過程におけるTTNの関与を示す,GO分析による有害な変異であることを示した。TTN変異を検出するように設計したCRISPR-Cas12aアッセイは,WES分析と一致する結果を提供し,さらにサンガー配列決定により確認した。本研究は,モヤモヤ病の新しい家族性遺伝子マーカーとしてTTNを認識し,さらに,CRISPR-Cas12aが迅速検出,低コストおよび簡単な操作の利点を有し,MMD突然変異部位の迅速検出の実用化において広い展望を有することを実証した。Copyright 2022 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  遺伝病 ,  *突然変異 ,  ヌクレオチド配列 ,  *変異 ,  クラスタ化 ,  有害性 ,  母集団 ,  点突然変異 ,  *モヤモヤ病 ,  病因
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノム配列 ,  変異頻度 ,  *全エクソーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： モヤモヤ病 ,  TTN ,  CRISPR-Cas12a ,  RNF213 ,  MMP3

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J)

引用文献 (55件)：

• AdzhubeiI., JordanD. M., SunyaevS. R. (2013). Predicting Functional Effect of Human Missense Mutations Using PolyPhen-2. Curr. Protoc. Hum. Genet., Chapter 7, Unit7.20. doi: 10.1002/0471142905.hg0720s76
• AdzhubeiI. A., SchmidtS., PeshkinL., RamenskyV. E., GerasimovaA., BorkP., et al (2010). A Method and Server for Predicting Damaging Missense Mutations. Nat. Methods 7 (4), 248-249. doi: 10.1038/nmeth0410-248
• AutonA., AutonA., BrooksL. D., DurbinR. M., GarrisonE. P., KangH. M., et al (2015). A Global Reference for Human Genetic Variation. Nature 526 (7571), 68-74. doi: 10.1038/nature15393
• BindeaG., MlecnikB., HacklH., CharoentongP., TosoliniM., KirilovskyA., et al (2009). ClueGO: a Cytoscape Plug-In to Decipher Functionally Grouped Gene Ontology and Pathway Annotation Networks. Bioinformatics 25 (8), 1091-1093. doi: 10.1093/bioinformatics/btp101
• BrounsS. J. J., JoreM. M., LundgrenM., WestraE. R., SlijkhuisR. J. H., SnijdersA. P. L., et al (2008). Small CRISPR RNAs Guide Antiviral Defense in Prokaryotes. Science 321 (5891), 960-964. doi: 10.1126/science.1159689

タイトルに関連する用語 (6件)： 全エクソーム配列決定 ,  モヤモヤ病 ,  家族 ,  スクリーニング ,  CRISPR ,  研究