文献

J-GLOBAL ID：202202262426243874   整理番号：22A0944790

ウシゲノムにおける調節要素の機能的アノテーションは離乳時の第一胃発生における細胞外相互作用の役割とクロマチン状態の動的変化を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Functional annotation of regulatory elements in cattle genome reveals the roles of extracellular interaction and dynamic change of chromatin states in rumen development during weaning

著者 (11件)： Gao Yahui (Animal Genomics and Improvement Laboratory, BARC, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705, USA) ,  Gao Yahui (Department of Animal and Avian Sciences, University of Maryland, College Park, MD 20742, USA) ,  Liu Shuli (Animal Genomics and Improvement Laboratory, BARC, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705, USA) ,  Liu Shuli (College of Animal Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100193, China) ,  Baldwin VI Ransom L. (Animal Genomics and Improvement Laboratory, BARC, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705, USA) ,  Connor Erin E. (Department of Animal and Food Sciences, University of Delaware, Newark, DE 19716, USA) ,  Cole John B. (Animal Genomics and Improvement Laboratory, BARC, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705, USA) ,  Ma Li (Department of Animal and Avian Sciences, University of Maryland, College Park, MD 20742, USA) ,  Fang Lingzhao (MRC Human Genetics Unit at the Medical Research Council Institute of Genetics and Molecular Medicine, University of Edinburgh, Edinburgh EH4 2XU, United Kingdom) ,  Li Cong-jun (Animal Genomics and Improvement Laboratory, BARC, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705, USA) ,  Liu George E. (Animal Genomics and Improvement Laboratory, BARC, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705, USA)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 114  号： 2  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウシ調節要素の景観をプロファイリングし,離乳時の第一胃発達におけるクロマチン状態の動的変化を調べた。ウシにおける調節要素(15クロマチン状態)とそれらの協調活性を,第一胃上皮組織における4つのヒストン修飾,CTCF結合,DNAアクセシビリティ,DNAメチル化,およびトランスクリプトームのゲノムワイドプロファイリングを通して定義した。各クロマチン状態は配列オントロジー,メチル化,形質関連変異体,転写,遺伝子発現関連変異体,選択シグネチャ及び進化的保存要素に対する特異的濃縮を示した。離乳中,弱いエンハンサーおよび隣接活性転写開始部位(TSS)は,最も動的なクロマチン状態であり,遺伝子発現およびDNAメチル化の有意な変化とタンデムに生じ,身長,生産および生殖経済形質と有意に関連していた。in vitro培養上皮細胞及びin vivoルーメン組織と比較して,これらの結果の共通性と一意性,特に組織発生における細胞相互作用及びミトコンドリア活性の役割を示した。Copyright 2022 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *相互作用 ,  メチル化 ,  DNA【核酸】 ,  *クロマチン ,  *調節遺伝子 ,  転写【遺伝】 ,  化学修飾 ,  *ゲノム ,  *離乳 ,  遺伝子発現 ,  上皮細胞 ,  *アノテーション ,  オントロジー ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  ヒストン修飾 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ウシゲノム ,  機能的アノテーション ,  第一胃の発達 ,  クロマチン状態 ,  細胞相互作用 ,  酪酸

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (10件)： ウシ ,  ゲノム ,  調節要素 ,  アノテーション ,  離乳 ,  第一胃 ,  相互作用 ,  役割 ,  クロマチン ,  動的変化